128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1956 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  48.14 
 
 		 1321 aa  885    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  48.37 
 
 		 1338 aa  924    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  44.51 
 
 		 1322 aa  762    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  43.72 
 
 		 1318 aa  746    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  39.98 
 
 		 1354 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  44 
 
 		 1331 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  54 
 
 		 1219 aa  1037    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  43.28 
 
 		 1358 aa  740    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  42.03 
 
 		 1336 aa  705    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  40.37 
 
 		 1355 aa  738    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  100 
 
 		 1055 aa  2094    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  40.04 
 
 		 1319 aa  625  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1333 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1422 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1373 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1339 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  37.36 
 
 		 1306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  36.18 
 
 		 1338 aa  566  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  37.45 
 
 		 1322 aa  552  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  40.49 
 
 		 1712 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  39.49 
 
 		 1343 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  39.77 
 
 		 1442 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1282 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1290 aa  222  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1243 aa  217  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  37.95 
 
 		 926 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1250 aa  183  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1250 aa  181  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.02 
 
 		 1432 aa  174  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1332 aa  169  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  19.46 
 
 		 1277 aa  164  8.000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  19.86 
 
 		 1278 aa  160  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1375 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1022 aa  158  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1098 aa  148  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  21.83 
 
 		 826 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1349 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1581 aa  138  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1709 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1612 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1298 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1426 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1339 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1339 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1347 aa  103  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1461 aa  102  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.76 
 
 		 1640 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1409 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1640 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1642 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1644 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1365 aa  95.9  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1440 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1557 aa  95.5  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1363 aa  95.1  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1452 aa  94.7  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1441 aa  94  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1346 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.36 
 
 		 974 aa  92  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1347 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1321 aa  90.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1353 aa  89.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  35.93 
 
 		 1572 aa  88.6  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1366 aa  88.2  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1751 aa  87  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  34.86 
 
 		 846 aa  87  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1342 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1579 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  36.14 
 
 		 1581 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1575 aa  83.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.08 
 
 		 1573 aa  75.1  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.95 
 
 		 995 aa  73.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  29.19 
 
 		 950 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.82 
 
 		 1041 aa  72.4  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1177 aa  72  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1210 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.24 
 
 		 1002 aa  69.3  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.52 
 
 		 1170 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1178 aa  68.9  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.35 
 
 		 1020 aa  68.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.8 
 
 		 1058 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1546 aa  67  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  35.33 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1147 aa  61.6  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 		 1038 aa  60.1  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  35.71 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.74 
 
 		 1186 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1036 aa  58.9  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  30.52 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  18.79 
 
 		 1089 aa  58.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1104 aa  57.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1088 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.31 
 
 		 1076 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1039 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  28.74 
 
 		 1159 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1299 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1941  hypothetical protein  57.89 
 
 		 67 aa  55.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.19 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1120 aa  52.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>