104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1315 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  35.9 
 
 
1579 aa  771    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  100 
 
 
1751 aa  3603    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  36.34 
 
 
1642 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  36.27 
 
 
1640 aa  732    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.42 
 
 
1640 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  36.59 
 
 
1644 aa  754    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  34.2 
 
 
1546 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  35.74 
 
 
1557 aa  716    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.26 
 
 
1573 aa  616  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  32.99 
 
 
1581 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  31.08 
 
 
1575 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  32.18 
 
 
1572 aa  509  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.01 
 
 
1432 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.59 
 
 
1343 aa  141  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.37 
 
 
1354 aa  132  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  25.36 
 
 
1282 aa  128  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.49 
 
 
1342 aa  125  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.04 
 
 
1290 aa  119  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  35.05 
 
 
1338 aa  105  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.22 
 
 
1321 aa  104  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  22.28 
 
 
1318 aa  103  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.52 
 
 
1441 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.48 
 
 
1712 aa  100  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  24.59 
 
 
1440 aa  99  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  28.88 
 
 
1250 aa  99  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  28.88 
 
 
1250 aa  99  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.92 
 
 
1353 aa  98.6  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.8 
 
 
1339 aa  98.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  28.29 
 
 
1336 aa  97.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.31 
 
 
1461 aa  97.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.52 
 
 
1452 aa  95.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  23.33 
 
 
1355 aa  94  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.47 
 
 
1612 aa  91.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.08 
 
 
1373 aa  90.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.22 
 
 
1332 aa  90.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  28.24 
 
 
1319 aa  89  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.3 
 
 
1331 aa  88.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28.05 
 
 
1442 aa  88.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.36 
 
 
1333 aa  88.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  32.8 
 
 
1055 aa  86.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.13 
 
 
1347 aa  86.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  33.82 
 
 
846 aa  86.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.86 
 
 
1322 aa  85.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  22.64 
 
 
1409 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  24.12 
 
 
1338 aa  84.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  23.66 
 
 
1709 aa  83.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.43 
 
 
1363 aa  83.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.37 
 
 
1339 aa  83.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.37 
 
 
1339 aa  83.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25 
 
 
1426 aa  82.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  33.14 
 
 
1219 aa  80.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  23.58 
 
 
1358 aa  79.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  33.75 
 
 
1321 aa  77.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  27.46 
 
 
1306 aa  77.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  24.39 
 
 
1346 aa  77.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.33 
 
 
1366 aa  75.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  28.4 
 
 
1422 aa  72.8  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.94 
 
 
1058 aa  72  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  33.1 
 
 
1347 aa  71.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.83 
 
 
1277 aa  70.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.76 
 
 
1278 aa  68.9  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.64 
 
 
1375 aa  68.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.64 
 
 
1022 aa  67.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.83 
 
 
1098 aa  65.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  34.81 
 
 
1365 aa  65.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  30.67 
 
 
1459 aa  64.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  28.4 
 
 
1089 aa  63.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30.57 
 
 
995 aa  63.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.22 
 
 
1186 aa  62.8  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  35 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  26.85 
 
 
1243 aa  62  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.35 
 
 
1252 aa  61.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  31.11 
 
 
1581 aa  61.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.55 
 
 
1209 aa  61.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  22.44 
 
 
1349 aa  60.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  28.93 
 
 
926 aa  58.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  28.57 
 
 
1170 aa  58.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.35 
 
 
1257 aa  58.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  30.83 
 
 
1298 aa  58.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  32.21 
 
 
974 aa  58.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.81 
 
 
1244 aa  57.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  33.6 
 
 
1178 aa  55.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.95 
 
 
1132 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  32.09 
 
 
1041 aa  53.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.36 
 
 
1002 aa  53.1  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  27.04 
 
 
1039 aa  52.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  31.45 
 
 
1038 aa  51.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.44 
 
 
1020 aa  50.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  22.61 
 
 
1322 aa  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  35.96 
 
 
1210 aa  49.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  33.33 
 
 
1425 aa  49.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.82 
 
 
1154 aa  48.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.44 
 
 
1104 aa  48.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.17 
 
 
1147 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  36.36 
 
 
908 aa  47.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  25.3 
 
 
1282 aa  47.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  31.68 
 
 
1359 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.24 
 
 
1159 aa  46.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  28.8 
 
 
1022 aa  46.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  33.75 
 
 
792 aa  45.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>