153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6570 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  100 
 
 		 926 aa  1815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  35.46 
 
 		 1354 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  35.38 
 
 		 1322 aa  271  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  37.24 
 
 		 1219 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  35.42 
 
 		 1338 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  36.35 
 
 		 1321 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  35.79 
 
 		 1331 aa  238  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  31.13 
 
 		 1355 aa  235  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  33.68 
 
 		 1358 aa  235  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  33.45 
 
 		 1318 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1333 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  37.63 
 
 		 1055 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  33.63 
 
 		 1336 aa  226  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  32.3 
 
 		 1306 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1373 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1282 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1422 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1290 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1459 aa  216  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.55 
 
 		 1319 aa  212  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  29.04 
 
 		 1712 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.01 
 
 		 1343 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  33.45 
 
 		 1322 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1339 aa  174  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1338 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1243 aa  144  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  32.39 
 
 		 795 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1039 aa  125  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1339 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1339 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1612 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1098 aa  109  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.24 
 
 		 1432 aa  108  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1321 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.67 
 
 		 950 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1347 aa  105  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1461 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1365 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1581 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1409 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  24.44 
 
 		 410 aa  102  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1347 aa  101  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  20.35 
 
 		 1277 aa  100  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1440 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  19.34 
 
 		 1250 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1022 aa  100  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  19.34 
 
 		 1250 aa  99.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  20.53 
 
 		 1278 aa  98.2  6e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1363 aa  98.2  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1342 aa  97.8  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1452 aa  97.4  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1375 aa  97.8  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1353 aa  95.1  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.74 
 
 		 1194 aa  94  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  20.74 
 
 		 404 aa  94  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  26.5 
 
 		 1442 aa  92  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1366 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  32.93 
 
 		 846 aa  89  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.04 
 
 		 1186 aa  88.6  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1441 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1346 aa  85.5  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1332 aa  84.3  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.82 
 
 		 974 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1557 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1349 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1640 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1572 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  19.57 
 
 		 1089 aa  74.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1546 aa  73.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1642 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.05 
 
 		 1640 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1709 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1644 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1751 aa  71.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.01 
 
 		 1058 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  31.47 
 
 		 1581 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1426 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1579 aa  67.8  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1575 aa  67.4  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.72 
 
 		 1573 aa  66.6  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1154 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.74 
 
 		 1002 aa  64.7  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1104 aa  64.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 1041 aa  61.2  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1299 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.71 
 
 		 1132 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  24.69 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  32.78 
 
 		 1189 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.19 
 
 		 995 aa  58.9  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.46 
 
 		 882 aa  58.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1036 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  33.57 
 
 		 629 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  24.62 
 
 		 914 aa  55.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  36.11 
 
 		 792 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1209 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  30.71 
 
 		 1222 aa  55.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1195 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>