152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0272 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  37.74 
 
 		 1322 aa  708    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  37.05 
 
 		 1321 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  37 
 
 		 1338 aa  677    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  47.78 
 
 		 1319 aa  1110    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  39.34 
 
 		 1318 aa  775    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  44.37 
 
 		 1306 aa  998    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  42.14 
 
 		 1354 aa  1013    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  47.39 
 
 		 1459 aa  1069    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  38.73 
 
 		 1331 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  41.61 
 
 		 1336 aa  847    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  38.76 
 
 		 1338 aa  785    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1373 aa  774    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1422 aa  738    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1333 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  100 
 
 		 1322 aa  2694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  36.13 
 
 		 1355 aa  770    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  36.55 
 
 		 1358 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1339 aa  763    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  38.55 
 
 		 1712 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  34.37 
 
 		 1343 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  37.1 
 
 		 1219 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  37.1 
 
 		 1055 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1282 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1290 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1243 aa  358  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  32.4 
 
 		 1442 aa  290  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1250 aa  198  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  20.53 
 
 		 1250 aa  196  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1375 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1022 aa  177  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  35.25 
 
 		 926 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1098 aa  170  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.08 
 
 		 1432 aa  168  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  26.21 
 
 		 826 aa  166  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1332 aa  163  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.67 
 
 		 1277 aa  152  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.53 
 
 		 1278 aa  146  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1612 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1349 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1581 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1461 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1426 aa  112  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1709 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1452 aa  108  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1366 aa  107  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1363 aa  106  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1321 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1441 aa  103  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1339 aa  99  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1339 aa  99  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  34.29 
 
 		 846 aa  98.6  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1347 aa  97.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1346 aa  97.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1342 aa  96.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1347 aa  94.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1353 aa  92.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1440 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1365 aa  88.2  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.93 
 
 		 1640 aa  88.2  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1572 aa  87  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1409 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1298 aa  85.9  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1642 aa  85.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1557 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1644 aa  84.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  31.84 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1640 aa  82  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1579 aa  81.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.75 
 
 		 974 aa  81.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1104 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  31.45 
 
 		 1041 aa  74.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1575 aa  74.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.6 
 
 		 995 aa  73.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.98 
 
 		 1581 aa  73.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.49 
 
 		 1089 aa  73.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  30.38 
 
 		 1222 aa  69.7  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.54 
 
 		 1058 aa  69.3  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1546 aa  69.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  29.87 
 
 		 1189 aa  68.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.82 
 
 		 1076 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  20.92 
 
 		 1256 aa  67.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1195 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  32.7 
 
 		 1208 aa  65.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1036 aa  65.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.97 
 
 		 950 aa  65.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1209 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1147 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1231 aa  63.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.44 
 
 		 1002 aa  63.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.85 
 
 		 978 aa  63.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.38 
 
 		 1186 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.01 
 
 		 1132 aa  60.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1751 aa  60.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1209 aa  59.7  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.17 
 
 		 1573 aa  59.3  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.79 
 
 		 1252 aa  58.9  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1282 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  31.62 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1231 aa  57  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>