85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0971 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  46.99 
 
 
1239 aa  1011    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  47.63 
 
 
1189 aa  993    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  55.52 
 
 
1209 aa  1299    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  45.67 
 
 
1233 aa  1003    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  45.43 
 
 
1231 aa  970    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  46.72 
 
 
1208 aa  1054    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  100 
 
 
1222 aa  2513    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  49.48 
 
 
1195 aa  1099    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  34.64 
 
 
1282 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.78 
 
 
950 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.97 
 
 
995 aa  77.4  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.65 
 
 
1612 aa  73.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.99 
 
 
1177 aa  72  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.72 
 
 
1319 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.34 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.38 
 
 
1338 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  32.59 
 
 
1038 aa  66.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.78 
 
 
1331 aa  65.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.5 
 
 
557 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  32.77 
 
 
1231 aa  64.3  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  32.84 
 
 
1016 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  20.05 
 
 
974 aa  62.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.48 
 
 
1036 aa  61.6  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  35.9 
 
 
1459 aa  59.7  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  31.72 
 
 
1432 aa  59.3  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30.83 
 
 
1358 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.61 
 
 
746 aa  58.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.04 
 
 
1339 aa  57.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.57 
 
 
1209 aa  57.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  20.29 
 
 
1170 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.01 
 
 
795 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22.49 
 
 
562 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.52 
 
 
1422 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.77 
 
 
1058 aa  57.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.1 
 
 
1125 aa  57.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.07 
 
 
1322 aa  57.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  20.53 
 
 
1132 aa  56.2  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  18.27 
 
 
1020 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  27.22 
 
 
1322 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.23 
 
 
836 aa  55.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  23.44 
 
 
518 aa  53.5  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  27.85 
 
 
478 aa  54.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.75 
 
 
493 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  35.14 
 
 
1373 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  29.82 
 
 
1306 aa  53.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  31.3 
 
 
1298 aa  52.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.75 
 
 
1178 aa  52.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  20.85 
 
 
694 aa  52  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  22.91 
 
 
489 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  32.5 
 
 
1093 aa  51.6  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  30.58 
 
 
1338 aa  51.6  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  36.25 
 
 
1324 aa  51.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  21.72 
 
 
1002 aa  51.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  34.71 
 
 
1243 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.36 
 
 
1712 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  29.82 
 
 
1055 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  32.5 
 
 
1321 aa  50.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.39 
 
 
489 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.75 
 
 
1426 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  22.81 
 
 
489 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 
1041 aa  50.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.81 
 
 
1219 aa  50.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  31.54 
 
 
1336 aa  49.7  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.34 
 
 
1321 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.99 
 
 
1354 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  35.96 
 
 
1333 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  37.31 
 
 
908 aa  48.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.73 
 
 
1154 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.53 
 
 
1159 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  32.5 
 
 
1355 aa  48.5  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.03 
 
 
1250 aa  47.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.03 
 
 
1250 aa  47.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  21.41 
 
 
1131 aa  46.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  33.33 
 
 
1425 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.34 
 
 
1098 aa  46.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  25.66 
 
 
652 aa  45.8  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  39.19 
 
 
1318 aa  45.8  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.6 
 
 
1375 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  21.73 
 
 
484 aa  45.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  36.92 
 
 
1430 aa  45.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  22.55 
 
 
500 aa  45.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  28.72 
 
 
1182 aa  45.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 
477 aa  45.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.97 
 
 
929 aa  45.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.98 
 
 
792 aa  44.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>