95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3742 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1640 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  100 
 
 		 1575 aa  3195    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  33 
 
 		 1640 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  59.27 
 
 		 1572 aa  1808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  46.62 
 
 		 1581 aa  1288    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  44.11 
 
 		 1573 aa  1094    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1557 aa  695    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  44.25 
 
 		 1546 aa  1098    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1579 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1644 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1642 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1751 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.15 
 
 		 1343 aa  158  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.46 
 
 		 1432 aa  149  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1321 aa  132  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.06 
 
 		 1712 aa  126  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1338 aa  125  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1333 aa  124  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1581 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1342 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1426 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1353 aa  115  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1373 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.25 
 
 		 1354 aa  112  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1612 aa  112  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.49 
 
 		 1322 aa  112  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1282 aa  110  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1339 aa  108  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1290 aa  106  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.06 
 
 		 1336 aa  106  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26.47 
 
 		 846 aa  105  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1422 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1461 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  28.86 
 
 		 1306 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1452 aa  102  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.17 
 
 		 1338 aa  99.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1441 aa  99.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  26.21 
 
 		 1355 aa  98.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1243 aa  98.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  28.36 
 
 		 1331 aa  97.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.56 
 
 		 1219 aa  97.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.34 
 
 		 1358 aa  97.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1709 aa  97.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1332 aa  97.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1409 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.71 
 
 		 1277 aa  94.4  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.36 
 
 		 1278 aa  93.6  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1375 aa  93.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1022 aa  92  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.42 
 
 		 1318 aa  90.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1459 aa  90.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1250 aa  87.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1366 aa  87.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1250 aa  86.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1098 aa  86.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.05 
 
 		 1319 aa  85.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.13 
 
 		 1321 aa  83.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  35.62 
 
 		 1055 aa  83.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1365 aa  79.7  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1363 aa  73.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1347 aa  73.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  24 
 
 		 1349 aa  73.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1339 aa  72  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1339 aa  72  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  24.44 
 
 		 1442 aa  70.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1346 aa  69.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1347 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.01 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  22.88 
 
 		 1322 aa  60.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  31.65 
 
 		 1089 aa  58.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1440 aa  57  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  33.02 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.38 
 
 		 995 aa  55.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  31.25 
 
 		 882 aa  55.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1147 aa  53.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  28.86 
 
 		 926 aa  53.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1104 aa  51.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.4 
 
 		 1252 aa  51.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.4 
 
 		 1244 aa  50.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1298 aa  49.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  29.23 
 
 		 838 aa  49.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1231 aa  49.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.19 
 
 		 1058 aa  49.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.4 
 
 		 1257 aa  49.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1184 aa  48.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.65 
 
 		 1256 aa  48.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1088 aa  48.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1178 aa  47  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.67 
 
 		 1186 aa  47  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1177 aa  46.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.37 
 
 		 1020 aa  46.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1039 aa  46.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  20.25 
 
 		 1047 aa  45.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  37.5 
 
 		 792 aa  45.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.93 
 
 		 1170 aa  45.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>