143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1948 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  100 
 
 		 1089 aa  2217    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  34.89 
 
 		 1159 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  31.12 
 
 		 1170 aa  298  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  32.75 
 
 		 1177 aa  277  8e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1178 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1120 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1147 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1210 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.95 
 
 		 1132 aa  185  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  28.75 
 
 		 1076 aa  181  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1039 aa  179  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1088 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1184 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  25.81 
 
 		 882 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1104 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  26.27 
 
 		 1257 aa  141  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  28.5 
 
 		 816 aa  141  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1209 aa  139  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.92 
 
 		 1256 aa  137  9e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  26.93 
 
 		 1244 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.76 
 
 		 1252 aa  132  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  25.54 
 
 		 1186 aa  132  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1154 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1298 aa  128  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  26.88 
 
 		 792 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1338 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.83 
 
 		 1194 aa  122  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1299 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.18 
 
 		 1432 aa  105  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1476  hypothetical protein  29.91 
 
 		 247 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000317669  normal  0.706918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  21.15 
 
 		 1343 aa  87.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1612 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1373 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.9 
 
 		 838 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.53 
 
 		 974 aa  82  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  22.89 
 
 		 1319 aa  79.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1347 aa  79.7  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  21.81 
 
 		 1354 aa  79.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  21.77 
 
 		 1318 aa  79  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 1041 aa  78.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1339 aa  77  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1338 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  24.88 
 
 		 652 aa  74.3  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  21.68 
 
 		 1338 aa  72.4  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1333 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  19.41 
 
 		 1442 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1422 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  22.39 
 
 		 1322 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  22.9 
 
 		 1355 aa  70.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1321 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  20.14 
 
 		 1336 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  23.04 
 
 		 1358 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1290 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  21.61 
 
 		 1331 aa  68.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  21.31 
 
 		 1712 aa  68.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  20.51 
 
 		 1321 aa  67.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1282 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  20.21 
 
 		 1322 aa  65.1  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1441 aa  65.1  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  33.33 
 
 		 1058 aa  64.7  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  20 
 
 		 1219 aa  64.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1426 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1751 aa  63.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  19.36 
 
 		 1461 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.32 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1452 aa  62.4  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1572 aa  62  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1243 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1125 aa  60.1  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  18.96 
 
 		 732 aa  59.3  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1575 aa  58.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.57 
 
 		 836 aa  58.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1339 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  30.82 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1339 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1363 aa  57.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1346 aa  57.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1365 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1347 aa  56.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  30.23 
 
 		 405 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  27.44 
 
 		 1581 aa  56.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.19 
 
 		 995 aa  56.2  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  20.32 
 
 		 1306 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23.44 
 
 		 978 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1642 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1353 aa  55.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1644 aa  55.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1036 aa  55.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  25.13 
 
 		 846 aa  55.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1425 aa  55.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  19.28 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1342 aa  55.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1640 aa  55.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  19.31 
 
 		 1375 aa  54.7  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1241 aa  54.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 673 aa  53.5  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 493 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  32.59 
 
 		 1144 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1459 aa  52.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.61 
 
 		 1640 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>