138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2727 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  57.54 
 
 		 1440 aa  1510    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1339 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  39.65 
 
 		 1347 aa  882    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1441 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1365 aa  875    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1339 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1452 aa  755    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  38.43 
 
 		 1461 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1366 aa  802    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  50.18 
 
 		 1347 aa  1185    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  58.53 
 
 		 1346 aa  1546    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  100 
 
 		 1363 aa  2770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1409 aa  897    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1342 aa  552  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1321 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  31.59 
 
 		 1353 aa  513  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  38.64 
 
 		 846 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1243 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  45.22 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1290 aa  374  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  37.43 
 
 		 1282 aa  329  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1581 aa  194  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.05 
 
 		 1432 aa  159  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1151 aa  154  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  24.31 
 
 		 512 aa  152  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  33.51 
 
 		 1343 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1422 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  27.72 
 
 		 925 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.27 
 
 		 978 aa  140  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1188 aa  138  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1173 aa  136  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  32.2 
 
 		 1306 aa  134  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1338 aa  131  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1022 aa  131  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1375 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  31.32 
 
 		 1331 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1170 aa  128  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  28.35 
 
 		 918 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  29.15 
 
 		 1712 aa  126  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  26.15 
 
 		 869 aa  124  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1018 aa  124  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1459 aa  122  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  31.23 
 
 		 1318 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1184 aa  119  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  32.35 
 
 		 1219 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.98 
 
 		 1338 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.15 
 
 		 1354 aa  114  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  29.06 
 
 		 1355 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.5 
 
 		 1322 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1154 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  29.09 
 
 		 973 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.43 
 
 		 1278 aa  114  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1339 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1098 aa  114  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.21 
 
 		 1277 aa  112  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  29.16 
 
 		 1358 aa  112  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1373 aa  109  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1332 aa  109  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.26 
 
 		 1319 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1333 aa  108  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1612 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1349 aa  106  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1709 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  28.85 
 
 		 1321 aa  102  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1572 aa  98.2  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.45 
 
 		 1186 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  37.8 
 
 		 1336 aa  97.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  36.42 
 
 		 1055 aa  95.1  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.09 
 
 		 1159 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1426 aa  90.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.93 
 
 		 1322 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1579 aa  87.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  25.5 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1575 aa  85.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1250 aa  85.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1250 aa  85.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1751 aa  84.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1104 aa  78.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25 
 
 		 1557 aa  76.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  33.13 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  28 
 
 		 1442 aa  73.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.14 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1644 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  24.49 
 
 		 928 aa  72.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.43 
 
 		 1058 aa  71.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.74 
 
 		 1573 aa  70.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1184 aa  68.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  23.91 
 
 		 926 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.59 
 
 		 995 aa  66.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  23.46 
 
 		 1581 aa  65.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1088 aa  65.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1154 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  34.09 
 
 		 974 aa  64.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  23.64 
 
 		 871 aa  63.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.86 
 
 		 1640 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1642 aa  62.4  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.27 
 
 		 882 aa  62  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1298 aa  62.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1640 aa  61.6  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.53 
 
 		 926 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>