124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0326 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  100 
 
 		 1184 aa  2392    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1210 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.83 
 
 		 1159 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1120 aa  177  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1177 aa  174  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1039 aa  168  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1209 aa  166  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.48 
 
 		 1132 aa  158  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1178 aa  154  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.13 
 
 		 1076 aa  151  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.88 
 
 		 1089 aa  149  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1154 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1147 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1104 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.73 
 
 		 1170 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1338 aa  125  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1298 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.65 
 
 		 1244 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.9 
 
 		 1257 aa  110  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  22.65 
 
 		 882 aa  102  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.7 
 
 		 1252 aa  101  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  20.67 
 
 		 1256 aa  101  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1299 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.94 
 
 		 1194 aa  91.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1088 aa  91.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.17 
 
 		 995 aa  91.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1321 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  27.13 
 
 		 587 aa  88.6  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.94 
 
 		 1186 aa  87.4  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1347 aa  87.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1461 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 694 aa  85.9  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1346 aa  85.5  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1452 aa  85.1  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1342 aa  81.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.5 
 
 		 1432 aa  80.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1339 aa  79  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1339 aa  79  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1338 aa  77.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1347 aa  76.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1365 aa  75.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1441 aa  75.5  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.93 
 
 		 838 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1366 aa  73.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  37.61 
 
 		 974 aa  72.4  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1426 aa  71.6  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1363 aa  71.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1353 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3520  hypothetical protein  33.57 
 
 		 280 aa  70.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 504 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24 
 
 		 1354 aa  66.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25.73 
 
 		 1336 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1440 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.23 
 
 		 1319 aa  63.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.75 
 
 		 1058 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1339 aa  62.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  28.9 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1243 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.81 
 
 		 1640 aa  61.6  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1409 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  24.32 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1422 aa  61.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  24.3 
 
 		 1321 aa  59.7  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  19.11 
 
 		 1250 aa  59.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1036 aa  59.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  19.11 
 
 		 1250 aa  58.9  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.35 
 
 		 1322 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1642 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1318 aa  58.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  27.81 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1644 aa  58.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1425 aa  58.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1173 aa  57.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.86 
 
 		 836 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1612 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1188 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1290 aa  57.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  22.59 
 
 		 410 aa  55.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.18 
 
 		 1343 aa  55.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.68 
 
 		 1712 aa  55.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1373 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  29.33 
 
 		 626 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1557 aa  55.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  22.87 
 
 		 539 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  25.55 
 
 		 1322 aa  54.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.04 
 
 		 579 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1282 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.88 
 
 		 1186 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1184 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.15 
 
 		 522 aa  53.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  22.48 
 
 		 928 aa  52.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  17.31 
 
 		 1277 aa  52.8  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  33.07 
 
 		 478 aa  52.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  30.26 
 
 		 621 aa  51.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  22.96 
 
 		 534 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  28.24 
 
 		 518 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  19.72 
 
 		 524 aa  50.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  18.58 
 
 		 1278 aa  50.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  28.89 
 
 		 629 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>