66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1501 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1079    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  47.5 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  46.9 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2268  hypothetical protein  95.19 
 
 		 142 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  26.38 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  24.61 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.19 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24.7 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  24.95 
 
 		 554 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.76 
 
 		 524 aa  87  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  24.7 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  23.49 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.4 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.4 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  24.84 
 
 		 1257 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.69 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.8 
 
 		 950 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.23 
 
 		 1244 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.24 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  29.66 
 
 		 604 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.54 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  26.62 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  26.03 
 
 		 488 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.17 
 
 		 1194 aa  61.6  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.97 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  22.39 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  25.68 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  24.88 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1210 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  23 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1209 aa  57  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  20.27 
 
 		 527 aa  57  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  27.16 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.18 
 
 		 1076 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1177 aa  53.9  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.26 
 
 		 1132 aa  53.5  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1184 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.32 
 
 		 1159 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.8 
 
 		 1256 aa  51.6  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.57 
 
 		 1432 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  24.89 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1154 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  31.54 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1426 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28.89 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  22.73 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  20.85 
 
 		 673 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  33.33 
 
 		 995 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  24.75 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.12 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.26 
 
 		 1252 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.54 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  23.67 
 
 		 1669 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1379  modification methylase NspV  27.63 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  24.12 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  22.67 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  34.94 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  24.18 
 
 		 285 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  22.67 
 
 		 573 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1338 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  32.31 
 
 		 626 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  23.99 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 450 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>