54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1609 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1077    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  26.14 
 
 		 523 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.61 
 
 		 522 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  25.6 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  23.86 
 
 		 539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  22.85 
 
 		 552 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.97 
 
 		 527 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  22.45 
 
 		 554 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.47 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  20.12 
 
 		 489 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  27.12 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  26.8 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.27 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  20.89 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1210 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.38 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.59 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  20.42 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.65 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1104 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1184 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.53 
 
 		 974 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1177 aa  57.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1036 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  20.32 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1209 aa  54.3  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.15 
 
 		 995 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 405 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  24.48 
 
 		 495 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  23.93 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  21.95 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  23.58 
 
 		 725 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25 
 
 		 1426 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 815 aa  51.2  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.56 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  23.64 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1154 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  27.51 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 		 673 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1299 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  20.43 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  24.45 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  22.78 
 
 		 814 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1147 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  21.84 
 
 		 629 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.49 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  22.27 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  21.59 
 
 		 527 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  21.52 
 
 		 517 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.8 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  23.79 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  23.56 
 
 		 318 aa  43.5  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>