82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1897 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  816    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  33.41 
 
 
995 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  38.64 
 
 
404 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  30.32 
 
 
1036 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  29.96 
 
 
1257 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.83 
 
 
1186 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.5 
 
 
974 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.18 
 
 
1244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  27.47 
 
 
1147 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.15 
 
 
1177 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.49 
 
 
1076 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.4 
 
 
1612 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.72 
 
 
1154 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.46 
 
 
1209 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  28.02 
 
 
1159 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.95 
 
 
1299 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.11 
 
 
950 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.99 
 
 
1104 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.02 
 
 
1252 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.84 
 
 
836 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.27 
 
 
1194 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.98 
 
 
1426 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  20.99 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.7 
 
 
1120 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  30.64 
 
 
1039 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  26.02 
 
 
1020 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  30.33 
 
 
1132 aa  87.4  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  22.76 
 
 
926 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  44.44 
 
 
1178 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  34.87 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  26.18 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  36.51 
 
 
1432 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  32.21 
 
 
1256 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22.61 
 
 
562 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 
493 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  32.6 
 
 
1058 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  37.5 
 
 
1338 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.02 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  31.58 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  20.54 
 
 
557 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  29.37 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  27.56 
 
 
652 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25 
 
 
595 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  28.76 
 
 
1170 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.3 
 
 
1210 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1166  hypothetical protein  48.28 
 
 
60 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.86 
 
 
1125 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  22.59 
 
 
1184 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  23.5 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  28.68 
 
 
1282 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  22.85 
 
 
673 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  27.05 
 
 
570 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.78 
 
 
584 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  35.48 
 
 
1089 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  31.71 
 
 
612 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  26.83 
 
 
1189 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  27.52 
 
 
1241 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  27.09 
 
 
1183 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 
523 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  29.21 
 
 
1180 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  30.23 
 
 
573 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.51 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  41.27 
 
 
816 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  28.89 
 
 
522 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  30.65 
 
 
494 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  30.68 
 
 
1160 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 
533 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  18.04 
 
 
1209 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 
578 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 
578 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.8 
 
 
1195 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  19.7 
 
 
539 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  30.65 
 
 
494 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  26.45 
 
 
1222 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  39.34 
 
 
792 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.58 
 
 
1205 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  20.1 
 
 
534 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  25.61 
 
 
1375 aa  43.1  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>