141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0862 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  100 
 
 		 1132 aa  2348    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1209 aa  705    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1154 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1338 aa  523  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1120 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  30.89 
 
 		 1076 aa  488  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1177 aa  409  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.98 
 
 		 1257 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1039 aa  295  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.17 
 
 		 1244 aa  286  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  38.26 
 
 		 1159 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1299 aa  232  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1147 aa  228  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1178 aa  227  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  45.98 
 
 		 247 aa  204  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1426 aa  190  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.95 
 
 		 1089 aa  185  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.52 
 
 		 1170 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1036 aa  172  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1210 aa  166  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.99 
 
 		 995 aa  153  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25 
 
 		 1184 aa  152  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.67 
 
 		 1256 aa  147  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.67 
 
 		 974 aa  140  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.23 
 
 		 1252 aa  138  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.43 
 
 		 1432 aa  138  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1104 aa  118  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.79 
 
 		 1194 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.03 
 
 		 1058 aa  110  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1298 aa  105  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1612 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1125 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1088 aa  96.3  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.42 
 
 		 836 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.2 
 
 		 518 aa  93.6  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  21.96 
 
 		 557 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  29.41 
 
 		 838 aa  88.2  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.33 
 
 		 410 aa  87.4  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.08 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1231 aa  83.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.14 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.63 
 
 		 1186 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1241 aa  75.1  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1338 aa  74.7  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1339 aa  72.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.29 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  22.95 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.03 
 
 		 694 aa  68.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.71 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24 
 
 		 950 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  20.05 
 
 		 1239 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.69 
 
 		 416 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1347 aa  64.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1422 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  24.74 
 
 		 1336 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1452 aa  63.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.07 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  24.42 
 
 		 1205 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  19.81 
 
 		 1020 aa  62.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.54 
 
 		 1322 aa  62  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1333 aa  62  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.83 
 
 		 1319 aa  61.6  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1339 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1339 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  24.79 
 
 		 478 aa  60.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.65 
 
 		 1331 aa  60.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.88 
 
 		 652 aa  60.1  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1459 aa  58.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.19 
 
 		 1358 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1373 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.97 
 
 		 612 aa  56.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1365 aa  55.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  23.76 
 
 		 466 aa  55.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1195 aa  55.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.92 
 
 		 1338 aa  55.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1243 aa  54.7  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1366 aa  54.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  21.55 
 
 		 1354 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  25.26 
 
 		 522 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1751 aa  53.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.17 
 
 		 1041 aa  53.5  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  25.74 
 
 		 1343 aa  53.5  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  21.05 
 
 		 795 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.84 
 
 		 1321 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  23.74 
 
 		 1180 aa  53.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  30.46 
 
 		 732 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  20.53 
 
 		 1222 aa  52.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  27.98 
 
 		 1318 aa  52.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  20.71 
 
 		 1183 aa  52.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.28 
 
 		 1306 aa  52.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  25.43 
 
 		 1322 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.19 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  24.7 
 
 		 1219 aa  52  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1162 aa  51.6  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  31.62 
 
 		 730 aa  51.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1363 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.4 
 
 		 389 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1461 aa  50.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1324 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>