103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0182 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  100 
 
 		 1039 aa  2136    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1209 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  38.01 
 
 		 1076 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1154 aa  323  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1338 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  32.92 
 
 		 1132 aa  295  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  29.49 
 
 		 1159 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1178 aa  194  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  29.96 
 
 		 1089 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1177 aa  179  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1184 aa  166  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1120 aa  160  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1147 aa  159  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1210 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1298 aa  135  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  28.54 
 
 		 1170 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1104 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  28.25 
 
 		 926 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  27.9 
 
 		 1186 aa  102  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  22.84 
 
 		 882 aa  97.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.49 
 
 		 1194 aa  95.9  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1088 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.64 
 
 		 410 aa  93.2  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.65 
 
 		 1256 aa  91.7  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  25.06 
 
 		 1257 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.13 
 
 		 1252 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.06 
 
 		 995 aa  80.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  25.06 
 
 		 1244 aa  79.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.05 
 
 		 974 aa  77.4  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.03 
 
 		 1432 aa  77  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  19.71 
 
 		 950 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.47 
 
 		 1020 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  26.27 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1338 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1339 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.3 
 
 		 1058 aa  70.1  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1332 aa  68.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  24.53 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1336 aa  67.8  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  20.24 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1125 aa  66.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.92 
 
 		 1318 aa  65.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  27.72 
 
 		 1319 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1299 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1422 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.02 
 
 		 416 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.6 
 
 		 1277 aa  60.1  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.56 
 
 		 1278 aa  59.3  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  27.67 
 
 		 1343 aa  58.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1426 aa  57.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.49 
 
 		 1041 aa  57.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.31 
 
 		 1338 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1036 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1243 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.54 
 
 		 1055 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  24.91 
 
 		 621 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1459 aa  55.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.74 
 
 		 1358 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.38 
 
 		 652 aa  54.3  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  25.93 
 
 		 1442 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  24.9 
 
 		 1219 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1751 aa  52.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.6 
 
 		 1322 aa  53.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  22.69 
 
 		 1208 aa  52.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1373 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1022 aa  52.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.82 
 
 		 836 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1612 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.53 
 
 		 1306 aa  51.6  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1195 aa  51.6  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  23.28 
 
 		 934 aa  51.6  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1375 aa  51.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23 
 
 		 978 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1250 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  24.49 
 
 		 1321 aa  49.7  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  25.31 
 
 		 1354 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1452 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1250 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1353 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  34.64 
 
 		 1343 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1342 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  24.19 
 
 		 928 aa  48.9  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1333 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23 
 
 		 1241 aa  48.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1282 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  25 
 
 		 1440 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1441 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1461 aa  47.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  24.12 
 
 		 926 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  29.82 
 
 		 1322 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  27.6 
 
 		 1144 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1346 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1355 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1209 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  25 
 
 		 941 aa  47  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1575 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  24.27 
 
 		 921 aa  45.8  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  42.53 
 
 		 1285 aa  45.8  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1321 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.98 
 
 		 612 aa  45.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>