83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1202 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  100 
 
 
1282 aa  2597    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  36.92 
 
 
1209 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  38.21 
 
 
1195 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  34.81 
 
 
1222 aa  566  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  35.58 
 
 
1189 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  36.17 
 
 
1233 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  33.58 
 
 
1231 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  36.05 
 
 
1239 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  33.57 
 
 
1208 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.1 
 
 
974 aa  82.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.22 
 
 
995 aa  79.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.25 
 
 
1020 aa  74.7  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.49 
 
 
950 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 
1038 aa  70.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.18 
 
 
1058 aa  70.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.58 
 
 
836 aa  68.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.24 
 
 
1036 aa  64.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.03 
 
 
1177 aa  64.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 
746 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  32.37 
 
 
1358 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  26.14 
 
 
612 aa  62.4  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  31.16 
 
 
792 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  30.41 
 
 
1338 aa  60.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.86 
 
 
416 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  38.14 
 
 
1319 aa  60.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.61 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  32.67 
 
 
1322 aa  58.9  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  33.61 
 
 
1298 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  29.78 
 
 
1022 aa  56.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  33.82 
 
 
1339 aa  55.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.33 
 
 
1076 aa  55.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  26.38 
 
 
1140 aa  55.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  24.72 
 
 
1125 aa  55.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  30.82 
 
 
1231 aa  55.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.7 
 
 
1002 aa  54.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.04 
 
 
1205 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  30.72 
 
 
1336 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  26.43 
 
 
1425 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.17 
 
 
1432 aa  55.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28.68 
 
 
410 aa  54.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25 
 
 
1183 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  32.26 
 
 
1219 aa  53.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.37 
 
 
1180 aa  53.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  33.04 
 
 
1321 aa  53.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  20.96 
 
 
1144 aa  52.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.53 
 
 
1459 aa  52.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  28.8 
 
 
1422 aa  52.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  30.88 
 
 
1373 aa  52  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22.84 
 
 
562 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.09 
 
 
1182 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  26.25 
 
 
1306 aa  51.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  29.37 
 
 
478 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  34.45 
 
 
1322 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.61 
 
 
1338 aa  50.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  31.85 
 
 
1333 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  36.76 
 
 
1219 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  29.61 
 
 
1331 aa  50.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  21.67 
 
 
1178 aa  49.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  22.55 
 
 
967 aa  48.9  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  40.74 
 
 
1324 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  30.22 
 
 
518 aa  48.5  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 
694 aa  48.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  34.92 
 
 
1093 aa  48.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.71 
 
 
1170 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  22.56 
 
 
1039 aa  48.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.97 
 
 
1712 aa  48.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.3 
 
 
1751 aa  47.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  31.75 
 
 
1016 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 
1041 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.09 
 
 
1321 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 
908 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  28.18 
 
 
1186 aa  46.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  33.61 
 
 
1055 aa  46.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.65 
 
 
1426 aa  46.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  25.25 
 
 
1125 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  26.42 
 
 
1171 aa  46.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.92 
 
 
1186 aa  45.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  22.9 
 
 
1359 aa  45.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  20.67 
 
 
1612 aa  45.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  33.66 
 
 
1355 aa  45.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4624  hypothetical protein  28.68 
 
 
448 aa  45.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.977454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  28.93 
 
 
1282 aa  45.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.36 
 
 
1318 aa  45.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>