112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1545 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  49.56 
 
 		 1222 aa  1101    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  41.89 
 
 		 1208 aa  852    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 1195 aa  2437    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  46.03 
 
 		 1231 aa  1025    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  48.3 
 
 		 1239 aa  1008    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  46.17 
 
 		 1233 aa  983    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  50.04 
 
 		 1189 aa  1043    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  51.07 
 
 		 1209 aa  1108    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1282 aa  559  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.79 
 
 		 995 aa  99.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1036 aa  93.2  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.83 
 
 		 416 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.81 
 
 		 836 aa  91.3  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.39 
 
 		 950 aa  91.3  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.39 
 
 		 1058 aa  86.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1177 aa  72.8  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1125 aa  71.6  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 		 1038 aa  68.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1338 aa  68.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  31.73 
 
 		 1358 aa  67.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  31.1 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.24 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.28 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1612 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.61 
 
 		 1041 aa  63.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  28.91 
 
 		 1319 aa  62.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1231 aa  62.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  26.87 
 
 		 746 aa  62  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1178 aa  61.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1140 aa  60.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  24.52 
 
 		 795 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.8 
 
 		 1322 aa  59.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  24.3 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  34.03 
 
 		 1459 aa  58.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  31.55 
 
 		 1321 aa  58.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.53 
 
 		 1002 aa  57.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.16 
 
 		 1432 aa  57.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  26.77 
 
 		 1219 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  34.64 
 
 		 1322 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1426 aa  56.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.09 
 
 		 1336 aa  56.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1093 aa  55.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.25 
 
 		 974 aa  55.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.5 
 
 		 1132 aa  55.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1131 aa  55.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.57 
 
 		 1170 aa  54.7  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1339 aa  55.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  24.85 
 
 		 612 aa  54.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  20.48 
 
 		 1209 aa  54.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1250 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1250 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1298 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.81 
 
 		 1219 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  40 
 
 		 1324 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.87 
 
 		 1256 aa  52.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  36 
 
 		 1144 aa  52  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.91 
 
 		 1257 aa  52  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1039 aa  52  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1171 aa  51.6  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.83 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.17 
 
 		 1252 aa  51.6  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  33.6 
 
 		 1354 aa  51.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  40 
 
 		 1430 aa  50.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  22.4 
 
 		 908 aa  50.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  20.98 
 
 		 775 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1104 aa  50.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  22.63 
 
 		 484 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1184 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  26.09 
 
 		 914 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  25 
 
 		 908 aa  49.3  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1016 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  28.06 
 
 		 1277 aa  49.7  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.1 
 
 		 1331 aa  48.9  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1243 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1338 aa  48.5  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1422 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1359 aa  48.5  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  36.36 
 
 		 1318 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1154 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1373 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1210 aa  48.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 694 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1173 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  27.91 
 
 		 518 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  36.76 
 
 		 1183 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1333 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1375 aa  47.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1022 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1098 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  31.58 
 
 		 926 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  32.32 
 
 		 1159 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1147 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  28.08 
 
 		 1160 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  22.9 
 
 		 554 aa  46.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  28.48 
 
 		 1055 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1162 aa  46.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1365 aa  46.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1151 aa  46.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>