48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0162 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 1016 aa  2092    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 1038 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  27.26 
 
 		 1022 aa  298  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.66 
 
 		 1002 aa  231  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 746 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 908 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.11 
 
 		 950 aa  95.1  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  29.8 
 
 		 372 aa  84  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.54 
 
 		 1020 aa  82.8  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.3 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.72 
 
 		 995 aa  80.9  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  32.84 
 
 		 1222 aa  64.7  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  24.78 
 
 		 1189 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1036 aa  64.3  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1209 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.12 
 
 		 974 aa  64.3  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 554 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  22.81 
 
 		 492 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  22.22 
 
 		 775 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.23 
 
 		 462 aa  54.3  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  20.69 
 
 		 494 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1233 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  24.33 
 
 		 846 aa  52  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  33.33 
 
 		 595 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.98 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1231 aa  48.9  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.68 
 
 		 584 aa  48.9  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  25.28 
 
 		 504 aa  48.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.51 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1282 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  35.29 
 
 		 1277 aa  47.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  37.31 
 
 		 1278 aa  47.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  25.3 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1333 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  26.09 
 
 		 1252 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  20.59 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  24.22 
 
 		 477 aa  47  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 		 694 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 493 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  22.56 
 
 		 834 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  28.4 
 
 		 1319 aa  46.2  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  22.27 
 
 		 495 aa  46.2  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1459 aa  45.8  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.98 
 
 		 795 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  22.97 
 
 		 509 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.57 
 
 		 505 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  31.08 
 
 		 481 aa  44.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>