64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4283 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  100 
 
 
1233 aa  2519    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  45.2 
 
 
1189 aa  954    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  45.67 
 
 
1222 aa  1030    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  39.18 
 
 
1208 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  48.51 
 
 
1209 aa  1084    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  47.81 
 
 
1231 aa  1101    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  46.94 
 
 
1239 aa  1030    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  46.17 
 
 
1195 aa  1011    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  35.78 
 
 
1282 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  21.49 
 
 
995 aa  76.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  35.48 
 
 
1038 aa  68.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.39 
 
 
950 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  20 
 
 
1177 aa  66.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.22 
 
 
1058 aa  64.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.43 
 
 
1612 aa  62  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.46 
 
 
1002 aa  60.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  19.02 
 
 
836 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  29.05 
 
 
1338 aa  58.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  21.77 
 
 
1432 aa  57.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.91 
 
 
1339 aa  56.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.06 
 
 
1358 aa  56.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  22.28 
 
 
557 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  19.96 
 
 
1170 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  38.14 
 
 
746 aa  55.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.58 
 
 
1319 aa  55.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.7 
 
 
1322 aa  55.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.55 
 
 
1426 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  36.19 
 
 
1373 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  24.18 
 
 
518 aa  53.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
1016 aa  52.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.5 
 
 
1321 aa  52.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  27.61 
 
 
1430 aa  52.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26.04 
 
 
1167 aa  52  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  30.08 
 
 
1093 aa  51.6  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  20.42 
 
 
1036 aa  51.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  21.2 
 
 
478 aa  51.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  18.76 
 
 
974 aa  50.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  19.1 
 
 
416 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.83 
 
 
1219 aa  50.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.39 
 
 
562 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.26 
 
 
1076 aa  49.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  20.78 
 
 
1209 aa  48.9  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  28.14 
 
 
795 aa  49.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.91 
 
 
1132 aa  48.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  21.68 
 
 
1278 aa  48.5  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25 
 
 
694 aa  48.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  29.11 
 
 
1231 aa  48.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  36.94 
 
 
1243 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.74 
 
 
1333 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  33 
 
 
1422 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  30.97 
 
 
1459 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  21.36 
 
 
1147 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  30.17 
 
 
1298 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  25 
 
 
673 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.96 
 
 
1219 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.97 
 
 
1354 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.18 
 
 
1020 aa  46.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.72 
 
 
1546 aa  46.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.82 
 
 
1321 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  24.78 
 
 
570 aa  45.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  32.32 
 
 
1324 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  21.24 
 
 
1277 aa  45.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  32 
 
 
1318 aa  45.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  24.49 
 
 
1336 aa  44.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>