88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1916 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  100 
 
 		 1430 aa  2941    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  65.64 
 
 		 288 aa  382  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1241 aa  281  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1359 aa  260  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.14 
 
 		 1180 aa  239  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  23.22 
 
 		 1183 aa  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1270 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  26.34 
 
 		 1205 aa  234  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.14 
 
 		 1160 aa  228  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1171 aa  224  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1162 aa  223  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.12 
 
 		 1167 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1182 aa  211  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1140 aa  208  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.17 
 
 		 1144 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  24.13 
 
 		 1219 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1125 aa  191  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1174 aa  189  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1131 aa  184  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1425 aa  174  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1326 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  26.46 
 
 		 612 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1324 aa  161  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1497 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1218 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1129 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1484 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1154 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1154 aa  128  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1174 aa  125  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1162 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1141 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  26.4 
 
 		 309 aa  103  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.05 
 
 		 706 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  22.28 
 
 		 731 aa  94.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1107 aa  93.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  33.88 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 		 974 aa  66.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  35.04 
 
 		 1239 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1339 aa  62  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  49.25 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  43.08 
 
 		 746 aa  58.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.37 
 
 		 1058 aa  56.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.56 
 
 		 1041 aa  55.5  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1147 aa  54.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1298 aa  53.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  36.76 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1233 aa  52.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1333 aa  52.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1243 aa  52  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  39.74 
 
 		 1189 aa  51.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.89 
 
 		 1712 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  35.29 
 
 		 1318 aa  51.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1422 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  40 
 
 		 1195 aa  50.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.12 
 
 		 995 aa  51.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  24.78 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.04 
 
 		 1432 aa  50.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25 
 
 		 950 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1209 aa  49.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1373 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  26.62 
 
 		 1338 aa  48.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  38.81 
 
 		 1038 aa  48.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  28.22 
 
 		 1354 aa  48.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  27.74 
 
 		 1306 aa  48.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  19.07 
 
 		 882 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 477 aa  48.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  35.14 
 
 		 792 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1104 aa  47.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.01 
 
 		 1358 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  34.12 
 
 		 684 aa  47.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  32.14 
 
 		 1319 aa  47.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 		 493 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1178 aa  46.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  32.97 
 
 		 570 aa  46.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  28.12 
 
 		 1277 aa  46.6  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  28.12 
 
 		 1278 aa  45.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  31.51 
 
 		 1336 aa  45.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  37.31 
 
 		 929 aa  45.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  37.5 
 
 		 1343 aa  45.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  32.88 
 
 		 1355 aa  45.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.45 
 
 		 1132 aa  45.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1173 aa  45.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.18 
 
 		 838 aa  45.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  36.92 
 
 		 1222 aa  45.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1210 aa  45.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1612 aa  45.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>