105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0601 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  51.12 
 
 		 1324 aa  1303    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 1497 aa  3035    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  86.82 
 
 		 1484 aa  2377    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  57.43 
 
 		 1425 aa  1641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1270 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1140 aa  257  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1359 aa  238  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  25.77 
 
 		 1180 aa  221  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25 
 
 		 1182 aa  214  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1241 aa  205  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  24.13 
 
 		 1183 aa  197  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  24.77 
 
 		 1160 aa  193  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1162 aa  189  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1131 aa  182  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  24.6 
 
 		 1205 aa  182  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1171 aa  180  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1326 aa  166  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1430 aa  163  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1218 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.19 
 
 		 1219 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  23.97 
 
 		 612 aa  155  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  24.53 
 
 		 1167 aa  152  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1162 aa  150  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1141 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1154 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1129 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1154 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  23.17 
 
 		 1144 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  26.45 
 
 		 731 aa  125  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1107 aa  122  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1174 aa  121  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1174 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  27.66 
 
 		 309 aa  97.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1125 aa  97.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1177 aa  84  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.63 
 
 		 706 aa  82.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  28.65 
 
 		 300 aa  70.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.63 
 
 		 1194 aa  70.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  28.27 
 
 		 288 aa  70.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1120 aa  67  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  20.62 
 
 		 882 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1154 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.35 
 
 		 838 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.19 
 
 		 882 aa  62.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  33.62 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  37.14 
 
 		 416 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.34 
 
 		 1076 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.91 
 
 		 1058 aa  57.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1036 aa  57.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1104 aa  57  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30 
 
 		 995 aa  56.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1257 aa  55.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1244 aa  55.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.63 
 
 		 694 aa  55.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  24.52 
 
 		 816 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  41.03 
 
 		 974 aa  54.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1088 aa  52.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  28.57 
 
 		 1256 aa  52.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  31.36 
 
 		 518 aa  52  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1347 aa  52  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1581 aa  51.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1338 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  28.28 
 
 		 332 aa  52  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  39.47 
 
 		 1239 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  29.31 
 
 		 578 aa  50.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 1041 aa  50.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  30.17 
 
 		 1186 aa  50.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  35.23 
 
 		 1319 aa  50.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1210 aa  50.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1298 aa  50.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.66 
 
 		 836 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1557 aa  49.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  37.23 
 
 		 629 aa  49.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.13 
 
 		 595 aa  48.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1339 aa  48.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  33.73 
 
 		 1432 aa  48.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  39.53 
 
 		 795 aa  48.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  25.74 
 
 		 579 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 578 aa  48.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30 
 
 		 1422 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  22.35 
 
 		 492 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 570 aa  47.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1321 aa  47  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1579 aa  46.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1459 aa  47  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1751 aa  47  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  31.51 
 
 		 934 aa  47  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1338 aa  47  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.83 
 
 		 1089 aa  47  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1282 aa  47  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  35.29 
 
 		 1170 aa  46.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  30.21 
 
 		 792 aa  46.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.74 
 
 		 1343 aa  46.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1338 aa  45.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.02 
 
 		 1322 aa  45.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 746 aa  45.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1642 aa  45.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.02 
 
 		 1640 aa  45.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>