49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1132 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1141 aa  1149    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  53.66 
 
 		 1154 aa  1208    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 1174 aa  2402    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  54.67 
 
 		 1154 aa  1216    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  61.64 
 
 		 1162 aa  1484    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  47.55 
 
 		 1107 aa  1068    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1129 aa  900    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  44.72 
 
 		 731 aa  618  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  45.43 
 
 		 389 aa  330  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  28.99 
 
 		 1183 aa  164  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1182 aa  161  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1174 aa  155  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1425 aa  152  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1171 aa  152  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1162 aa  148  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  25.43 
 
 		 612 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1140 aa  145  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  27.21 
 
 		 1180 aa  144  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1131 aa  144  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  25.91 
 
 		 1205 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.33 
 
 		 1219 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1430 aa  141  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  27.49 
 
 		 1167 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  25.04 
 
 		 1144 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  24.34 
 
 		 1160 aa  135  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1484 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1218 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1497 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1324 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1359 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1125 aa  92.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1241 aa  91.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1270 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  21.76 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.14 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1326 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.41 
 
 		 950 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  25.3 
 
 		 309 aa  50.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  21.49 
 
 		 1239 aa  50.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  23.62 
 
 		 288 aa  47.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  32.46 
 
 		 489 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.91 
 
 		 929 aa  46.2  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.51 
 
 		 706 aa  46.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1339 aa  46.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  19.72 
 
 		 1058 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  25.97 
 
 		 332 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.14 
 
 		 1319 aa  45.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  31.58 
 
 		 489 aa  44.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1195 aa  44.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>