94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1235 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 1484 aa  3017    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  50 
 
 		 1324 aa  1288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  54.51 
 
 		 1425 aa  1539    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  86.62 
 
 		 1497 aa  2409    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1270 aa  284  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  24.26 
 
 		 1160 aa  250  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1359 aa  234  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1140 aa  228  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  24.39 
 
 		 1205 aa  225  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1241 aa  216  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  24.68 
 
 		 1183 aa  214  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  25.36 
 
 		 1180 aa  213  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  24.53 
 
 		 1167 aa  213  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1182 aa  199  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1131 aa  192  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  22.76 
 
 		 1144 aa  190  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1171 aa  189  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1162 aa  188  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1326 aa  170  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1162 aa  155  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1430 aa  152  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1141 aa  149  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  24.36 
 
 		 612 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.58 
 
 		 1219 aa  143  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1129 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1154 aa  140  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1154 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1218 aa  135  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1174 aa  129  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1107 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  25.52 
 
 		 731 aa  104  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1174 aa  100  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  28.74 
 
 		 309 aa  97.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.27 
 
 		 706 aa  93.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1125 aa  90.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1177 aa  82  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  28.27 
 
 		 288 aa  70.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  28.65 
 
 		 300 aa  70.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1154 aa  62  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.69 
 
 		 1058 aa  59.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1120 aa  58.9  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  37.14 
 
 		 416 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1104 aa  58.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1244 aa  55.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1257 aa  55.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  28.32 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  41.03 
 
 		 974 aa  54.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  27.55 
 
 		 332 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  31.25 
 
 		 882 aa  53.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.95 
 
 		 882 aa  53.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  28.57 
 
 		 1256 aa  52.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  39.53 
 
 		 950 aa  52  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1581 aa  51.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.41 
 
 		 995 aa  51.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  22.8 
 
 		 838 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  30.17 
 
 		 1186 aa  50.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1298 aa  51.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  35.23 
 
 		 1319 aa  50.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  39.47 
 
 		 1239 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 694 aa  50.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  28.93 
 
 		 836 aa  49.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  38 
 
 		 795 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  33.73 
 
 		 1432 aa  48.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1339 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.46 
 
 		 792 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30 
 
 		 1422 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1321 aa  47  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1751 aa  47  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1338 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.79 
 
 		 527 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1459 aa  46.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 746 aa  47  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 		 1041 aa  46.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  31.51 
 
 		 934 aa  46.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1088 aa  47  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1579 aa  46.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  28.74 
 
 		 1343 aa  46.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  35.29 
 
 		 1170 aa  46.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  32.2 
 
 		 652 aa  46.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1338 aa  46.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  23.92 
 
 		 1089 aa  46.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1644 aa  46.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.02 
 
 		 1640 aa  46.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1642 aa  46.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1640 aa  45.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.97 
 
 		 1322 aa  45.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1195 aa  45.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1147 aa  45.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1036 aa  45.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  28.26 
 
 		 1318 aa  45.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1209 aa  45.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>