43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1709 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  49.7 
 
 		 1141 aa  1053    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  54.67 
 
 		 1174 aa  1183    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  44.72 
 
 		 1129 aa  886    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  86.22 
 
 		 1154 aa  2029    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1107 aa  1002    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 1154 aa  2374    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  58.02 
 
 		 1162 aa  1350    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  43.68 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  47.18 
 
 		 389 aa  337  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.95 
 
 		 1219 aa  168  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1140 aa  160  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  28.17 
 
 		 1180 aa  157  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1182 aa  146  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1171 aa  144  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  29.07 
 
 		 1183 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26.67 
 
 		 1167 aa  142  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1270 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1324 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1174 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  28.87 
 
 		 1205 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1162 aa  134  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1497 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1484 aa  131  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  27.3 
 
 		 612 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1430 aa  128  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  29.06 
 
 		 1160 aa  128  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1131 aa  127  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  25.53 
 
 		 1144 aa  124  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1425 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1359 aa  103  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1241 aa  95.1  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1218 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1125 aa  78.2  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1326 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  22.64 
 
 		 882 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.39 
 
 		 706 aa  55.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  34.72 
 
 		 309 aa  53.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  28.46 
 
 		 1058 aa  51.6  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  37.14 
 
 		 1239 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  35.38 
 
 		 746 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1231 aa  45.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.98 
 
 		 1041 aa  45.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>