68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  100 
 
 		 1140 aa  2349    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  74.65 
 
 		 1131 aa  1695    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  34.1 
 
 		 1144 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  41.36 
 
 		 1171 aa  896    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  41.31 
 
 		 1174 aa  840    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  42.93 
 
 		 1162 aa  904    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  34.9 
 
 		 1160 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  38.91 
 
 		 1183 aa  780    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  41.95 
 
 		 1182 aa  904    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  34.1 
 
 		 1205 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  34.49 
 
 		 1180 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  32.99 
 
 		 1167 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  32.85 
 
 		 1219 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1270 aa  393  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  38.74 
 
 		 612 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1218 aa  346  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1324 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  40.74 
 
 		 332 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1497 aa  233  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1241 aa  233  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1359 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1125 aa  213  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1425 aa  211  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1430 aa  208  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1484 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1162 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1154 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1154 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1141 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  22.79 
 
 		 706 aa  137  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1326 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1174 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1107 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  21.13 
 
 		 882 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.64 
 
 		 731 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1129 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.45 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.03 
 
 		 995 aa  69.7  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.69 
 
 		 1058 aa  68.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  25.68 
 
 		 288 aa  67.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  26.27 
 
 		 1239 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1195 aa  60.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  32.41 
 
 		 974 aa  61.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.33 
 
 		 950 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.35 
 
 		 836 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  38.83 
 
 		 106 aa  59.7  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  41.1 
 
 		 416 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1282 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  39.74 
 
 		 929 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1231 aa  53.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1178 aa  53.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1209 aa  51.6  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1036 aa  51.6  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1104 aa  48.9  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.46 
 
 		 1089 aa  48.5  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  19.31 
 
 		 1041 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.97 
 
 		 795 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.31 
 
 		 1020 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1177 aa  47.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 455 aa  47  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.53 
 
 		 1252 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30.43 
 
 		 1358 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  29.35 
 
 		 481 aa  45.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 746 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.52 
 
 		 1002 aa  45.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  24.71 
 
 		 389 aa  45.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  38.81 
 
 		 918 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>