75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0295 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  39.05 
 
 
1183 aa  788    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  50.46 
 
 
1160 aa  1136    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  45.12 
 
 
1205 aa  951    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  34.66 
 
 
1182 aa  638    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  59.88 
 
 
1180 aa  1387    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  35.81 
 
 
1144 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  100 
 
 
1167 aa  2409    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  34.46 
 
 
1171 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  35.03 
 
 
1162 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  33.16 
 
 
1140 aa  601  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  34.68 
 
 
1174 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  31.5 
 
 
1131 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  30.41 
 
 
1219 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  41.13 
 
 
612 aa  453  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.85 
 
 
1270 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  31.74 
 
 
1218 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  25.23 
 
 
1241 aa  224  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  25.12 
 
 
1430 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.19 
 
 
1425 aa  211  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.98 
 
 
1484 aa  204  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26 
 
 
1324 aa  192  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.19 
 
 
1359 aa  191  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25.34 
 
 
1326 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  35.13 
 
 
332 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  27.09 
 
 
1141 aa  160  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.53 
 
 
1125 aa  159  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  26.44 
 
 
1154 aa  149  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  25.76 
 
 
1162 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  26.67 
 
 
1154 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.72 
 
 
1497 aa  138  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.61 
 
 
1129 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  27.49 
 
 
1174 aa  124  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  23.09 
 
 
731 aa  124  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  26.63 
 
 
1107 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  20.73 
 
 
882 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.32 
 
 
706 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  41.58 
 
 
106 aa  83.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.33 
 
 
1120 aa  82  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  26.22 
 
 
288 aa  76.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.06 
 
 
950 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  27.62 
 
 
300 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.38 
 
 
1036 aa  71.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.57 
 
 
1178 aa  68.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2506  type II restriction enzyme  45.07 
 
 
72 aa  64.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.14 
 
 
1170 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.14 
 
 
1058 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.56 
 
 
995 aa  61.6  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.88 
 
 
1426 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.13 
 
 
1177 aa  58.9  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.02 
 
 
792 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.6 
 
 
1231 aa  55.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.29 
 
 
974 aa  55.1  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.04 
 
 
1020 aa  54.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  39.77 
 
 
416 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  34.55 
 
 
1338 aa  53.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  38.89 
 
 
929 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  26.04 
 
 
1233 aa  52  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.08 
 
 
505 aa  52  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25.51 
 
 
1147 aa  52  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.35 
 
 
466 aa  51.6  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  27.09 
 
 
389 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.76 
 
 
1132 aa  47.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  26.1 
 
 
795 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  39.13 
 
 
871 aa  47  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  32.71 
 
 
1002 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.57 
 
 
1432 aa  46.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  32.5 
 
 
1243 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  31.67 
 
 
1333 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.18 
 
 
1209 aa  45.8  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  28.37 
 
 
1422 aa  45.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  37.5 
 
 
746 aa  45.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  34.38 
 
 
908 aa  45.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  39.51 
 
 
908 aa  44.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.76 
 
 
1318 aa  44.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>