24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2207 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  64.88 
 
 
1171 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  62.16 
 
 
1162 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  60.53 
 
 
1182 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  53.89 
 
 
1174 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  48.96 
 
 
1183 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  40.74 
 
 
1140 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  39.21 
 
 
1131 aa  252  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  36.69 
 
 
1160 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  35.46 
 
 
1205 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  34.72 
 
 
1180 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  35.03 
 
 
1144 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  35.4 
 
 
1219 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  35.13 
 
 
1167 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  38.83 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  26.55 
 
 
1359 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  29.3 
 
 
1324 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  27.55 
 
 
1484 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  28.28 
 
 
1497 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  23.66 
 
 
1270 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  25.97 
 
 
1174 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.16 
 
 
1425 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.53 
 
 
706 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.66 
 
 
1125 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>