33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3191 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  65.64 
 
 		 1430 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1241 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1326 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  29.84 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1359 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  29.38 
 
 		 1205 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  26.01 
 
 		 1180 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  26.22 
 
 		 1167 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1425 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  25.47 
 
 		 1160 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1171 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1270 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25.12 
 
 		 1183 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1218 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  26.69 
 
 		 1144 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  27.44 
 
 		 612 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1182 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1162 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1140 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1131 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1484 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1497 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1324 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1174 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1125 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1107 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  23.6 
 
 		 1219 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1154 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  23.21 
 
 		 731 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1162 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1154 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1141 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>