72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0339 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  37.44 
 
 
1171 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  40.52 
 
 
1183 aa  848    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  45.8 
 
 
1160 aa  1035    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  38.82 
 
 
1162 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  34.37 
 
 
1140 aa  642    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  36.86 
 
 
1182 aa  752    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  44.84 
 
 
1180 aa  986    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  35.71 
 
 
1174 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  100 
 
 
1205 aa  2512    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  34.76 
 
 
1144 aa  668    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  45.21 
 
 
1167 aa  955    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  31.87 
 
 
1219 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  31.21 
 
 
1131 aa  540  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  37.62 
 
 
612 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  33.28 
 
 
1218 aa  321  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  28.57 
 
 
1270 aa  250  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  25 
 
 
1430 aa  249  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.66 
 
 
1125 aa  240  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.13 
 
 
1359 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.04 
 
 
1324 aa  227  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23.58 
 
 
1241 aa  226  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.44 
 
 
1484 aa  214  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  34.59 
 
 
332 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.22 
 
 
1425 aa  176  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.78 
 
 
1497 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.86 
 
 
1141 aa  152  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  27.14 
 
 
1162 aa  139  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25.74 
 
 
1326 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  29.39 
 
 
1154 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  27.87 
 
 
1129 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  28.87 
 
 
1154 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  23.73 
 
 
706 aa  133  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  25.88 
 
 
1174 aa  129  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  25.45 
 
 
1107 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  27.27 
 
 
731 aa  118  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  25.41 
 
 
882 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  28.98 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  43.56 
 
 
106 aa  82  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  29.38 
 
 
288 aa  79.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  26.85 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.42 
 
 
1132 aa  63.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.61 
 
 
1058 aa  62.4  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.83 
 
 
1120 aa  61.6  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.07 
 
 
995 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  20.65 
 
 
1076 aa  58.9  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.7 
 
 
1178 aa  58.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2506  type II restriction enzyme  47.46 
 
 
72 aa  57.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.33 
 
 
974 aa  55.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.04 
 
 
1282 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23 
 
 
1209 aa  53.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.71 
 
 
929 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.54 
 
 
1231 aa  52.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  30.09 
 
 
950 aa  52  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  31.33 
 
 
1036 aa  51.6  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  40.68 
 
 
416 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.37 
 
 
1244 aa  50.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.37 
 
 
1257 aa  50.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  24.64 
 
 
1154 aa  48.9  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  23.26 
 
 
1338 aa  48.5  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.28 
 
 
1252 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  40.35 
 
 
1321 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.55 
 
 
1239 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  33.82 
 
 
908 aa  47.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  37.8 
 
 
926 aa  46.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 
1362 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.37 
 
 
1002 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  36.14 
 
 
918 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  36.36 
 
 
926 aa  46.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  38.6 
 
 
1342 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  20.44 
 
 
404 aa  45.8  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  32.97 
 
 
746 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  35.23 
 
 
928 aa  44.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>