66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2288 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1182 aa  818    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  100 
 
 		 1160 aa  2414    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  37.42 
 
 		 1162 aa  732    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  40.35 
 
 		 1183 aa  885    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1174 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  45.71 
 
 		 1205 aa  1033    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1171 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  50.5 
 
 		 1180 aa  1132    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  50.46 
 
 		 1167 aa  1127    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  41.4 
 
 		 1144 aa  853    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1131 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1140 aa  692    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  32.59 
 
 		 1219 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  40.94 
 
 		 612 aa  439  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1218 aa  355  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1324 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1125 aa  255  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1241 aa  249  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1425 aa  244  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1270 aa  244  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1484 aa  228  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1430 aa  228  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  36.69 
 
 		 332 aa  205  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1497 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1141 aa  163  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1162 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  26.55 
 
 		 731 aa  137  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1359 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1154 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1154 aa  128  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.86 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1174 aa  122  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1107 aa  115  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1129 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1326 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  29.69 
 
 		 309 aa  95.9  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.45 
 
 		 882 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  41.58 
 
 		 106 aa  89.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.19 
 
 		 995 aa  78.2  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.9 
 
 		 950 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  25.47 
 
 		 288 aa  74.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  23.79 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1036 aa  62  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  29.11 
 
 		 929 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2506  type II restriction enzyme  51.67 
 
 		 72 aa  61.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1120 aa  59.7  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1178 aa  58.9  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.48 
 
 		 1058 aa  58.9  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1177 aa  54.3  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.03 
 
 		 1020 aa  53.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1426 aa  52.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24.88 
 
 		 416 aa  52  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.79 
 
 		 1041 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  22.22 
 
 		 404 aa  50.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.53 
 
 		 974 aa  49.7  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.48 
 
 		 1132 aa  48.9  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 694 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1209 aa  47.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  27.27 
 
 		 908 aa  46.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1195 aa  46.2  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.67 
 
 		 836 aa  46.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 629 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.68 
 
 		 410 aa  45.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.34 
 
 		 918 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1422 aa  45.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  28.87 
 
 		 557 aa  44.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>