71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0561 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  65.48 
 
 		 1171 aa  1544    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  39.85 
 
 		 1131 aa  829    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  39.16 
 
 		 1205 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  43.07 
 
 		 1140 aa  912    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  57.6 
 
 		 1174 aa  1330    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  100 
 
 		 1162 aa  2411    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  37.5 
 
 		 1160 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  48.76 
 
 		 1183 aa  1090    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  57.17 
 
 		 1182 aa  1377    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  34.91 
 
 		 1180 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  35.2 
 
 		 1144 aa  635  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  35.11 
 
 		 1167 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  31.87 
 
 		 1219 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  46.24 
 
 		 612 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  75.56 
 
 		 1218 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  62.16 
 
 		 332 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1270 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1359 aa  250  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1324 aa  239  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1125 aa  229  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1430 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1241 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1497 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1484 aa  177  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1425 aa  175  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1326 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1141 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1162 aa  144  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1154 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1174 aa  136  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1154 aa  136  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1107 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  26.03 
 
 		 731 aa  124  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1129 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  24.32 
 
 		 706 aa  109  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  29.28 
 
 		 309 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.36 
 
 		 882 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1178 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  40.38 
 
 		 106 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  28.64 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.27 
 
 		 974 aa  67  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.95 
 
 		 1058 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.72 
 
 		 995 aa  66.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1177 aa  65.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1120 aa  64.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.26 
 
 		 950 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25 
 
 		 1147 aa  57.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  23.98 
 
 		 1239 aa  55.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  20.66 
 
 		 1020 aa  53.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.39 
 
 		 1132 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  44.93 
 
 		 416 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.79 
 
 		 836 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1231 aa  49.7  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.86 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  35.24 
 
 		 1358 aa  48.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  29.89 
 
 		 1252 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 604 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1339 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.64 
 
 		 1159 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1154 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.81 
 
 		 527 aa  46.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  28.7 
 
 		 584 aa  45.8  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1036 aa  46.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  19.18 
 
 		 494 aa  46.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.52 
 
 		 929 aa  45.8  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  32.26 
 
 		 481 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.89 
 
 		 1244 aa  45.8  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  36.92 
 
 		 746 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  29.89 
 
 		 1257 aa  45.8  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  27.68 
 
 		 652 aa  45.4  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>