60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4910 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 584 aa  1198    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  39.66 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  39.66 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  32.93 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  31.25 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  31.67 
 
 		 563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  32.92 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  22.2 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  27.49 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  24.04 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.31 
 
 		 974 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  25.14 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  22.3 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  21.94 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  23.36 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  28.63 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1125 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  21.13 
 
 		 527 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  20.95 
 
 		 1022 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  25.78 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.81 
 
 		 908 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  29.46 
 
 		 1089 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 		 480 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  26.63 
 
 		 834 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.17 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  22.43 
 
 		 1343 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  31.87 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  26.94 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  24.4 
 
 		 707 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.23 
 
 		 629 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  24.52 
 
 		 517 aa  47.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1182 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1093 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  23.36 
 
 		 494 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  21.74 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 694 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.84 
 
 		 950 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1162 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 1041 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  21.74 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1324 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.5 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 494 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1430 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  20.38 
 
 		 1002 aa  44.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  18.09 
 
 		 1058 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1022 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.87 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  21.3 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  21.65 
 
 		 768 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  25.12 
 
 		 846 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  21.3 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  23.27 
 
 		 329 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  31.78 
 
 		 1669 aa  44.3  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  26.37 
 
 		 486 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>