32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2496 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  65.1 
 
 		 504 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1024    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  59.06 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  57.2 
 
 		 527 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  43.1 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  40.62 
 
 		 509 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  38.43 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  29.89 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  26.16 
 
 		 604 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.63 
 
 		 595 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  22.5 
 
 		 405 aa  90.9  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.08 
 
 		 578 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.08 
 
 		 578 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  22.53 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.41 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  26.03 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  22.22 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.51 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  29.55 
 
 		 466 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.56 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  19.5 
 
 		 539 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  23.18 
 
 		 534 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0330  DNA methylase family protein  19.67 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.27 
 
 		 521 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  24.28 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  26.14 
 
 		 244 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.12 
 
 		 524 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  34.41 
 
 		 296 aa  43.9  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  21.99 
 
 		 673 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf681  methyltransferase, HsdM related  26.15 
 
 		 517 aa  43.5  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000145801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  24.63 
 
 		 494 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>