89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0121 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  100 
 
 		 1022 aa  2105    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 1038 aa  342  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1016 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.54 
 
 		 1002 aa  172  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 746 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  26.9 
 
 		 908 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.7 
 
 		 950 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.14 
 
 		 995 aa  83.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.28 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1800  hypothetical protein  24.6 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1036 aa  70.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.2 
 
 		 1020 aa  66.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  23.43 
 
 		 515 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.64 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  24.02 
 
 		 846 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 544 aa  57  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 544 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1338 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  23.61 
 
 		 775 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1298 aa  55.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 1358 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 544 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1347 aa  55.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.27 
 
 		 1338 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 834 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  20.95 
 
 		 584 aa  53.5  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  23.18 
 
 		 523 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1339 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  23.99 
 
 		 495 aa  52.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1339 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 513 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  26.59 
 
 		 477 aa  52.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  21.98 
 
 		 570 aa  52.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 508 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  22.88 
 
 		 517 aa  52  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 676 aa  52  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  24.3 
 
 		 605 aa  52  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  23.3 
 
 		 494 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  22.13 
 
 		 527 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.74 
 
 		 416 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  25.53 
 
 		 763 aa  51.2  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  19.89 
 
 		 974 aa  51.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  26.22 
 
 		 793 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1346 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1022 aa  51.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  23.48 
 
 		 687 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.94 
 
 		 694 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  21.69 
 
 		 568 aa  50.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1093 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 676 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 676 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  20.83 
 
 		 523 aa  48.9  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1336 aa  48.9  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  20.99 
 
 		 523 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.48 
 
 		 489 aa  48.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  23.02 
 
 		 795 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  22.82 
 
 		 510 aa  48.1  0.0009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  21.05 
 
 		 484 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  25.61 
 
 		 1331 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1282 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  21.05 
 
 		 515 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  21.28 
 
 		 849 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  22.66 
 
 		 489 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  20.67 
 
 		 481 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.11 
 
 		 1219 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  22.15 
 
 		 429 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1751 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  23.66 
 
 		 494 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 569 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  22.15 
 
 		 429 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  22.27 
 
 		 510 aa  46.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  26.86 
 
 		 1321 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1195 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.46 
 
 		 1132 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  23.87 
 
 		 748 aa  45.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.23 
 
 		 481 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  31.93 
 
 		 967 aa  45.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  21.01 
 
 		 492 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  26.25 
 
 		 1322 aa  45.8  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  21.59 
 
 		 515 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  22.62 
 
 		 503 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 493 aa  45.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  26.71 
 
 		 478 aa  45.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1366 aa  44.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  21.56 
 
 		 477 aa  45.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  21.33 
 
 		 1239 aa  45.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  20.88 
 
 		 569 aa  44.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  20.42 
 
 		 505 aa  45.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  22.69 
 
 		 810 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>