44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0392 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 967 aa  1962    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  20.75 
 
 		 694 aa  75.5  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.8 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.96 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  23.05 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  22.88 
 
 		 746 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.73 
 
 		 502 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1231 aa  53.5  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33 
 
 		 257 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.71 
 
 		 950 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 499 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 500 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.73 
 
 		 493 aa  52  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.73 
 
 		 1058 aa  51.2  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.24 
 
 		 1002 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.49 
 
 		 974 aa  50.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 768 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  24.21 
 
 		 501 aa  50.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  21.34 
 
 		 595 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.94 
 
 		 995 aa  49.7  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  22.79 
 
 		 526 aa  49.3  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  22.44 
 
 		 504 aa  48.5  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  23.04 
 
 		 792 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  21.88 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  27.08 
 
 		 479 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 489 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  25.52 
 
 		 489 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  23.51 
 
 		 499 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  23.19 
 
 		 730 aa  47  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  22.08 
 
 		 505 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 477 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  32.35 
 
 		 515 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  31.93 
 
 		 1022 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  23.65 
 
 		 526 aa  45.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  26.39 
 
 		 929 aa  45.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  23.75 
 
 		 578 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  23.75 
 
 		 578 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 522 aa  44.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.49 
 
 		 405 aa  44.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.52 
 
 		 1256 aa  44.7  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 480 aa  44.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  23.14 
 
 		 574 aa  44.3  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>