286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2727 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  50.68 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.83 
 
 
505 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.67 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.7 
 
 
502 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.67 
 
 
504 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.99 
 
 
505 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  30.99 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  30 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.71 
 
 
708 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.46 
 
 
860 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.47 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  31.97 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  26.03 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2564  hypothetical protein  42.68 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000782255  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  27.66 
 
 
891 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.81 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  29.94 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.08 
 
 
495 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.45 
 
 
816 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 
496 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  29.58 
 
 
527 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.81 
 
 
574 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  28.41 
 
 
526 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.81 
 
 
574 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  27.56 
 
 
492 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.09 
 
 
585 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  28.88 
 
 
540 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  29.91 
 
 
510 aa  64.7  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.99 
 
 
501 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  27.59 
 
 
527 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.83 
 
 
587 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 
508 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 
503 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  25.59 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 
808 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  32.67 
 
 
565 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 
501 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  35.09 
 
 
513 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.33 
 
 
549 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  31.36 
 
 
516 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 
517 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  30.91 
 
 
824 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  33.83 
 
 
541 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  33.06 
 
 
810 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 
481 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.67 
 
 
508 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.64 
 
 
501 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 
481 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 
513 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 
815 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 
505 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 
528 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  32.32 
 
 
544 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  31.39 
 
 
506 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  28.7 
 
 
515 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 
490 aa  58.9  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  27.03 
 
 
535 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  25.57 
 
 
505 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  29.6 
 
 
493 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 
543 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25.64 
 
 
495 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.86 
 
 
633 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  30.82 
 
 
809 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  31.3 
 
 
540 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  29.92 
 
 
481 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.52 
 
 
498 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 
814 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  34.26 
 
 
653 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  32.08 
 
 
188 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.27 
 
 
822 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  31.3 
 
 
489 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  30.56 
 
 
484 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.93 
 
 
522 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  31.3 
 
 
489 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  30.67 
 
 
847 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 
520 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  26.05 
 
 
520 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 
511 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  26.49 
 
 
519 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  30.1 
 
 
489 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.52 
 
 
497 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  30.97 
 
 
508 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  24.74 
 
 
514 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  25.38 
 
 
528 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 
517 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  31.78 
 
 
512 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.07 
 
 
517 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.61 
 
 
523 aa  55.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  32.04 
 
 
529 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  23.93 
 
 
494 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 
501 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  28.7 
 
 
519 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 
493 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  30.4 
 
 
524 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  30.11 
 
 
499 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.72 
 
 
500 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>