112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0792 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1173    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  49.74 
 
 		 595 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  51.83 
 
 		 604 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  36.53 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  36.53 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  34.43 
 
 		 563 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  32.43 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  29.89 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  26.79 
 
 		 495 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  26.62 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  27.98 
 
 		 504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  28.88 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  25.48 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.2 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  29.53 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 673 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  31.38 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  26.77 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.2 
 
 		 950 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.05 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1299 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.21 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  27.23 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  24.62 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.81 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.29 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  36.44 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 523 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1154 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  30.05 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  25.88 
 
 		 1285 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  23.47 
 
 		 1343 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  23.05 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1338 aa  57.4  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1231 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  26.03 
 
 		 552 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 1041 aa  55.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.81 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.24 
 
 		 792 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1036 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  24.75 
 
 		 478 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.51 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  31.25 
 
 		 1159 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1125 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  27.49 
 
 		 587 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  24.2 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.89 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0062  hypothetical protein  22.69 
 
 		 422 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.01 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2939  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 926 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1177 aa  50.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 926 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.89 
 
 		 1002 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  34.62 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  25.5 
 
 		 1703 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1459 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  30.23 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  31.82 
 
 		 1244 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1612 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.97 
 
 		 995 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  37.31 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  26.9 
 
 		 2077 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  30.21 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  25.65 
 
 		 1956 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.89 
 
 		 1669 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  25.76 
 
 		 1176 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.03 
 
 		 1257 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  32.53 
 
 		 1432 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  24.43 
 
 		 1121 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 846 aa  47.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  22.46 
 
 		 524 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  26.51 
 
 		 1669 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.68 
 
 		 488 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  31.62 
 
 		 1319 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 1575 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1426 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1422 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  26.67 
 
 		 553 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  25.73 
 
 		 1606 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.82 
 
 		 1089 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  34.81 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  32.46 
 
 		 1338 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  21.15 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  23.91 
 
 		 1613 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1925 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  27.27 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1022 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  30 
 
 		 1322 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 834 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  25.13 
 
 		 2117 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  29.91 
 
 		 1358 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>