More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2177 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  80.28 
 
 		 790 aa  1263    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  96.19 
 
 		 763 aa  1469    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  69.73 
 
 		 710 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  68.15 
 
 		 647 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  47.01 
 
 		 783 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 793 aa  1631    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  59.04 
 
 		 778 aa  922    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  45.91 
 
 		 793 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  46.51 
 
 		 787 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  45.13 
 
 		 829 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  59.92 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  45.18 
 
 		 794 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  49.08 
 
 		 677 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  61.06 
 
 		 552 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  52.19 
 
 		 725 aa  528  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.06 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  38.12 
 
 		 806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  46.96 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  36.04 
 
 		 777 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  36.2 
 
 		 708 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 		 661 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  45.87 
 
 		 676 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  45.87 
 
 		 676 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  43.63 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  36.15 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  42 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  41.94 
 
 		 658 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  33.77 
 
 		 728 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  33.58 
 
 		 725 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.13 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  42.66 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  44.83 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  43.05 
 
 		 580 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  41.84 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 592 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  41.44 
 
 		 655 aa  363  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  42.34 
 
 		 673 aa  360  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  41.7 
 
 		 611 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  38.04 
 
 		 670 aa  360  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  39.81 
 
 		 709 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  41.81 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  40.72 
 
 		 683 aa  350  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.12 
 
 		 663 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  40.16 
 
 		 583 aa  343  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  39.33 
 
 		 589 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.37 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  38.12 
 
 		 587 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.65 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  37.76 
 
 		 661 aa  310  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  37.03 
 
 		 675 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  36.93 
 
 		 675 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.7 
 
 		 691 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  36.01 
 
 		 799 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  36.02 
 
 		 659 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  65.13 
 
 		 196 aa  266  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  36.32 
 
 		 371 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 316 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  35.62 
 
 		 697 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.31 
 
 		 574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.98 
 
 		 633 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.35 
 
 		 587 aa  131  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  34.02 
 
 		 498 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.49 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.27 
 
 		 497 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  26.52 
 
 		 574 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 498 aa  124  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  34.12 
 
 		 822 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  24.76 
 
 		 520 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  24.76 
 
 		 520 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.77 
 
 		 585 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  31.33 
 
 		 518 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.86 
 
 		 511 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  31.33 
 
 		 518 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  31.33 
 
 		 518 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  31.33 
 
 		 518 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  34.71 
 
 		 504 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  34.27 
 
 		 496 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  28.96 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  34.83 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  30.91 
 
 		 810 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  29.32 
 
 		 499 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  28.1 
 
 		 508 aa  118  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.27 
 
 		 873 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 511 aa  117  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  30.28 
 
 		 810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  30.83 
 
 		 495 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.94 
 
 		 527 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.8 
 
 		 522 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  24.46 
 
 		 505 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 		 499 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  32.63 
 
 		 808 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  28.44 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  26.96 
 
 		 574 aa  115  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  29.63 
 
 		 799 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.88 
 
 		 508 aa  114  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  27.72 
 
 		 494 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>