159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3999 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 523 aa  1071    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  52.69 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  26.14 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  27.38 
 
 		 534 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  22.46 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25.05 
 
 		 539 aa  136  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.7 
 
 		 522 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  21.87 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.06 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  20.28 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  26.42 
 
 		 524 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.7 
 
 		 553 aa  107  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  28.86 
 
 		 405 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  17.62 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  24.65 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.36 
 
 		 527 aa  83.6  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.78 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  24.24 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  25.11 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  25.69 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  19.66 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.68 
 
 		 389 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  23.05 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1036 aa  70.5  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  26.73 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  22.14 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  27.57 
 
 		 1170 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 544 aa  67  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  28.96 
 
 		 974 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  19.57 
 
 		 694 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  27.95 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.15 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3524  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1210 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  24 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.66 
 
 		 995 aa  60.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  24.07 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  24.89 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24.15 
 
 		 1132 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1612 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1426 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1299 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1120 aa  57.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  20.08 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  20.08 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  26.45 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  24.56 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  24.56 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0548  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  23.98 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  26.18 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  23.57 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1147 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.09 
 
 		 950 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  23.39 
 
 		 328 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.21 
 
 		 1432 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  23.59 
 
 		 698 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  25.43 
 
 		 515 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.36 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1154 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  23.39 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  23.39 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.51 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 489 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.95 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  22.81 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.05 
 
 		 563 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  22.81 
 
 		 328 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  23.91 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.48 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  22.81 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1209 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.41 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1338 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  23.87 
 
 		 525 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 808 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  25.6 
 
 		 499 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.44 
 
 		 562 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 329 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  21.9 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  22.15 
 
 		 673 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 775 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  24.66 
 
 		 1285 aa  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  26.67 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  27.54 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 		 814 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  20.49 
 
 		 604 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  22.17 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.93 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  22.22 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  24.69 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>