48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0104 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0104  Eco57I restriction endonuclease  100 
 
 		 499 aa  1014    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  40.82 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4247  hypothetical protein  39.53 
 
 		 509 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102223  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  38.77 
 
 		 527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  39.28 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  38.43 
 
 		 488 aa  302  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  38.2 
 
 		 497 aa  286  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  28.86 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.73 
 
 		 595 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  26.76 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  22 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 		 578 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 		 578 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  24.89 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  27.78 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  28.69 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.45 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.57 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.32 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  26.19 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.26 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.69 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  25.91 
 
 		 1285 aa  50.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  30.97 
 
 		 244 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 		 1041 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  23.13 
 
 		 853 aa  47.8  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  29.22 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  34.26 
 
 		 1120 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  29.22 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  26.47 
 
 		 1244 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  26.34 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1147 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  27.21 
 
 		 1257 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1426 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1324 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.36 
 
 		 1432 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1425 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1036 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.41 
 
 		 974 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>