80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0129 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 533 aa  1081    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  52.69 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  28.02 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  26.38 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25.35 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  21.87 
 
 		 552 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  22.99 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  21.67 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  24.52 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  19.88 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  22.93 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  18.7 
 
 		 527 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  26.58 
 
 		 415 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  18.38 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  20.59 
 
 		 694 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  18.93 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3090  site-specific DNA-methyltransferase  26.38 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1210 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  21.62 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  22.41 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  20.47 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28 
 
 		 1612 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  22.08 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  22.08 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  23.74 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  24 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1036 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  24.88 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.82 
 
 		 1432 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  20.42 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  20.42 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.94 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.95 
 
 		 974 aa  57  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.35 
 
 		 2117 aa  55.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3524  N-6 DNA methylase  24.59 
 
 		 549 aa  54.3  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636426  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  22.51 
 
 		 573 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25.93 
 
 		 950 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  25.68 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  19.52 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  25.99 
 
 		 563 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 504 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.96 
 
 		 995 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  29.13 
 
 		 595 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  32.17 
 
 		 1186 aa  50.4  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  22.61 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  22.65 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0548  N-6 DNA methylase  22.81 
 
 		 541 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  23.53 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  30.19 
 
 		 625 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1338 aa  47  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1426 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  23.58 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  24.02 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  24.02 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  23.58 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  24.02 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.04 
 
 		 462 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1299 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  24.02 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  23.58 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  23.14 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  22.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.32 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1147 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1104 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  22.07 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  22.54 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  18.6 
 
 		 587 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 495 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 		 847 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>