More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3524 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  75.36 
 
 		 544 aa  844    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0636  N-6 DNA methylase  75.5 
 
 		 545 aa  851    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0548  N-6 DNA methylase  67.03 
 
 		 541 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3524  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 549 aa  1127    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.78 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  33.14 
 
 		 799 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  34.25 
 
 		 814 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  32.76 
 
 		 827 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  32.13 
 
 		 809 aa  160  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  29.48 
 
 		 523 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  31.58 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  31.54 
 
 		 799 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  31.78 
 
 		 808 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 		 523 aa  153  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.91 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  29.21 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  27.94 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.59 
 
 		 574 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  29.51 
 
 		 506 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  28.61 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  31.83 
 
 		 863 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  30.95 
 
 		 856 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  28.8 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  28.37 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.11 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  29.84 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  30.03 
 
 		 814 aa  148  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.69 
 
 		 855 aa  148  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 871 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.66 
 
 		 574 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.39 
 
 		 462 aa  146  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  29.24 
 
 		 810 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  28.12 
 
 		 853 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.05 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  29.47 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  29.3 
 
 		 808 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  30.25 
 
 		 847 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  30.42 
 
 		 862 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.79 
 
 		 503 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.05 
 
 		 585 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  29.47 
 
 		 527 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  25.91 
 
 		 535 aa  144  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.79 
 
 		 587 aa  143  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  30.46 
 
 		 519 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  29.31 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.25 
 
 		 815 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  28.77 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  27.51 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.79 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  30.18 
 
 		 874 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  31.44 
 
 		 863 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 518 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 518 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  27.99 
 
 		 547 aa  141  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  29.81 
 
 		 523 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 568 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  27.7 
 
 		 510 aa  140  6e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  29.89 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  32.84 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  31.74 
 
 		 910 aa  140  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  26.87 
 
 		 567 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  26.77 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  31.44 
 
 		 863 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  28 
 
 		 810 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  27.93 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  28.7 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.58 
 
 		 822 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 519 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  25.85 
 
 		 633 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  28.42 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  27.42 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  25.47 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  28.19 
 
 		 873 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  28.01 
 
 		 816 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  28.74 
 
 		 540 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  28.97 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  28.54 
 
 		 525 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  26.7 
 
 		 489 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  30.23 
 
 		 814 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.19 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  27.68 
 
 		 527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 501 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  24.84 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  24.69 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  26.28 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  27.34 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  26.28 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  27.43 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 		 567 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  27.96 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>