67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4383 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 		 489 aa  1004    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  61.89 
 
 		 527 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  33.47 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  32.99 
 
 		 552 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  30.48 
 
 		 553 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.32 
 
 		 524 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  27.3 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  27.04 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  25.89 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  20.12 
 
 		 521 aa  94  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  17.62 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  24.9 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  27.96 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  18.38 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.86 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.4 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.3 
 
 		 527 aa  70.1  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  31.44 
 
 		 587 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.86 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.7 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.65 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  26.47 
 
 		 629 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  22.49 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 673 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.58 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  26.29 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  37.37 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  31.71 
 
 		 1417 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  23.81 
 
 		 691 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  39.56 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.14 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.94 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  28.68 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.03 
 
 		 1722 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  24.57 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  30.25 
 
 		 1697 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  21.47 
 
 		 974 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  23.92 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  31.88 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  24.72 
 
 		 489 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  29.56 
 
 		 1697 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  20.72 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  30.25 
 
 		 1703 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  22.56 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  24.19 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  29.82 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1210 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  29.45 
 
 		 1700 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  24.57 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.25 
 
 		 1702 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.75 
 
 		 569 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1748 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1299 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  22.75 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  31.78 
 
 		 1693 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  26.79 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  32.35 
 
 		 2117 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1036 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  33.94 
 
 		 284 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  24.06 
 
 		 499 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  29.63 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  22.17 
 
 		 768 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 505 aa  43.5  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  31.71 
 
 		 1956 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>