16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0309 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1420    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.11 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  20.42 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 587 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.37 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.81 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  24.62 
 
 		 552 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 554 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.15 
 
 		 524 aa  47.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  21.95 
 
 		 539 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  23.24 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  21.85 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  32.73 
 
 		 583 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1210 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  24.79 
 
 		 730 aa  44.3  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>