69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2730 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.03 
 
 		 1649 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  32.87 
 
 		 1642 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.11 
 
 		 1932 aa  707    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  34.17 
 
 		 1669 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  33.76 
 
 		 1669 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  100 
 
 		 1722 aa  3517    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.07 
 
 		 2098 aa  693    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.99 
 
 		 1934 aa  733    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.29 
 
 		 1726 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  32.3 
 
 		 1706 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  31.2 
 
 		 2077 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  29.94 
 
 		 2117 aa  636  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.46 
 
 		 1703 aa  619  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.1 
 
 		 2274 aa  618  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 1697 aa  601  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1748 aa  599  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  31.93 
 
 		 1697 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 		 2570 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 		 1702 aa  580  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  30.67 
 
 		 1700 aa  572  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  31.41 
 
 		 1701 aa  573  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.92 
 
 		 1516 aa  562  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  30.31 
 
 		 1606 aa  548  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1575 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.91 
 
 		 1417 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.03 
 
 		 1674 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1693 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 1925 aa  436  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  31.52 
 
 		 1956 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  28.87 
 
 		 1211 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 2005 aa  369  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  29.42 
 
 		 1594 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 976 aa  298  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 761 aa  278  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  35.28 
 
 		 763 aa  271  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  35.43 
 
 		 766 aa  264  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  35.07 
 
 		 526 aa  160  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  38.13 
 
 		 470 aa  155  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 577 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  22.05 
 
 		 1328 aa  137  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  36.95 
 
 		 284 aa  110  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.41 
 
 		 1379 aa  91.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.27 
 
 		 254 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.91 
 
 		 339 aa  70.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.03 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 		 1105 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  39.29 
 
 		 663 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 673 aa  54.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 1108 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  39.29 
 
 		 773 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 		 1105 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 1110 aa  52.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  35.71 
 
 		 666 aa  52.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 866 aa  51.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 450 aa  49.3  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  24.89 
 
 		 341 aa  49.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  25.34 
 
 		 341 aa  48.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  38.03 
 
 		 872 aa  48.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.03 
 
 		 489 aa  48.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  37.35 
 
 		 777 aa  47.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  34.58 
 
 		 285 aa  47.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  28.81 
 
 		 946 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  29.36 
 
 		 896 aa  47  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  29.2 
 
 		 508 aa  45.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 		 898 aa  45.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.3 
 
 		 527 aa  45.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  29.12 
 
 		 389 aa  45.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 		 876 aa  45.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>