79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1466 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  100 
 
 		 1379 aa  2840    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  23.85 
 
 		 1925 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  23.9 
 
 		 1669 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  22.73 
 
 		 2570 aa  102  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  23.53 
 
 		 1606 aa  101  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  22.72 
 
 		 1669 aa  98.2  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  24.2 
 
 		 1575 aa  98.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  22.57 
 
 		 1642 aa  95.5  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  22.41 
 
 		 1722 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  20.37 
 
 		 2274 aa  89.4  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  24.64 
 
 		 1932 aa  89.4  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  19.3 
 
 		 763 aa  87.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  21.26 
 
 		 2098 aa  87  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  22.33 
 
 		 1697 aa  86.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  24.36 
 
 		 2077 aa  86.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  20.26 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  21.51 
 
 		 1956 aa  85.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  22.1 
 
 		 1700 aa  82.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  21.36 
 
 		 1706 aa  81.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  22.22 
 
 		 976 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  21.5 
 
 		 2005 aa  79.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  20.64 
 
 		 1726 aa  75.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  21.11 
 
 		 1697 aa  74.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  24.88 
 
 		 1649 aa  68.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 1702 aa  66.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  22.8 
 
 		 1701 aa  62.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  21.41 
 
 		 1594 aa  62  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  21.47 
 
 		 2117 aa  62  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  28.22 
 
 		 1693 aa  60.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  23.3 
 
 		 1211 aa  60.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  38.1 
 
 		 1328 aa  59.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  20.89 
 
 		 1703 aa  58.9  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1748 aa  56.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 1002 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 1674 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  22.5 
 
 		 1417 aa  56.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  22.33 
 
 		 1516 aa  55.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  23.59 
 
 		 1934 aa  55.5  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  43.08 
 
 		 889 aa  55.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  23.57 
 
 		 949 aa  54.3  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  20.83 
 
 		 678 aa  52.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.71 
 
 		 919 aa  52.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  22.99 
 
 		 951 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.18 
 
 		 1065 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.18 
 
 		 1065 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  30.77 
 
 		 933 aa  50.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 986 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  21.58 
 
 		 541 aa  50.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  25 
 
 		 894 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  27.34 
 
 		 526 aa  49.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.89 
 
 		 1212 aa  49.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.78 
 
 		 969 aa  49.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  23.35 
 
 		 1107 aa  48.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.81 
 
 		 949 aa  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  24.46 
 
 		 924 aa  47.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 674 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.34 
 
 		 952 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.61 
 
 		 958 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  36.84 
 
 		 927 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.61 
 
 		 958 aa  47.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.26 
 
 		 933 aa  47  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  21.76 
 
 		 467 aa  46.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 923 aa  47  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.87 
 
 		 971 aa  47  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.9 
 
 		 966 aa  46.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0642  transcription-repair coupling factor  29.82 
 
 		 1125 aa  46.2  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0432582  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.97 
 
 		 950 aa  46.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.17 
 
 		 805 aa  46.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.9 
 
 		 696 aa  45.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30 
 
 		 801 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  32.35 
 
 		 928 aa  45.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  28.16 
 
 		 922 aa  45.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.06 
 
 		 799 aa  45.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.11 
 
 		 910 aa  45.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  36.08 
 
 		 925 aa  45.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  32.39 
 
 		 940 aa  45.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  30.95 
 
 		 840 aa  45.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  23.93 
 
 		 1069 aa  45.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  30.93 
 
 		 898 aa  45.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>