98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4747 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.83 
 
 
1700 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  28.52 
 
 
1932 aa  663    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  36.75 
 
 
1642 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.44 
 
 
1649 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1925 aa  3864    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  44.67 
 
 
1575 aa  1199    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  33.6 
 
 
1748 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  32.77 
 
 
1702 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  33.22 
 
 
1697 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.3 
 
 
1516 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.39 
 
 
1693 aa  803    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  45.31 
 
 
1606 aa  1240    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  34.42 
 
 
1703 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  30.97 
 
 
2077 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  34.31 
 
 
1726 aa  783    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  35.49 
 
 
1956 aa  810    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.95 
 
 
1669 aa  823    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.21 
 
 
1669 aa  850    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  27.81 
 
 
1934 aa  662    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.03 
 
 
1701 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  32.45 
 
 
1697 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.94 
 
 
1706 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  34.64 
 
 
1417 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  35.11 
 
 
2098 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
1594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  30.93 
 
 
2274 aa  567  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
1674 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.1 
 
 
2117 aa  527  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
976 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
2570 aa  503  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  31.68 
 
 
1211 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.64 
 
 
2005 aa  467  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  33.68 
 
 
1722 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  32.99 
 
 
761 aa  278  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  27.58 
 
 
763 aa  254  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  27.9 
 
 
766 aa  191  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  37.68 
 
 
470 aa  187  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  34.36 
 
 
526 aa  147  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
577 aa  135  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.85 
 
 
1379 aa  122  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.27 
 
 
678 aa  94.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  35.68 
 
 
284 aa  93.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.27 
 
 
1328 aa  81.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  27.17 
 
 
339 aa  80.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  32 
 
 
341 aa  67.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  31.5 
 
 
341 aa  67  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  24.74 
 
 
872 aa  62.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  26.52 
 
 
468 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 
900 aa  55.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  25.93 
 
 
442 aa  55.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
1002 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  29.1 
 
 
254 aa  52.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  36.25 
 
 
919 aa  52.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  32.61 
 
 
894 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.67 
 
 
595 aa  51.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 
937 aa  51.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  26.46 
 
 
933 aa  50.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  32.5 
 
 
527 aa  50.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  22.3 
 
 
1222 aa  49.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.18 
 
 
1168 aa  49.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  28.47 
 
 
416 aa  49.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30 
 
 
1147 aa  48.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  35.48 
 
 
674 aa  48.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  34.23 
 
 
285 aa  48.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.82 
 
 
466 aa  47.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  36.25 
 
 
1116 aa  47.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  31.37 
 
 
560 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  34.15 
 
 
1071 aa  47.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.9 
 
 
1065 aa  47.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  28.57 
 
 
560 aa  47  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  27.95 
 
 
953 aa  47  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.12 
 
 
573 aa  47.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
1129 aa  47.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.9 
 
 
1065 aa  47.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.97 
 
 
952 aa  47.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  30 
 
 
1065 aa  47.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  33.06 
 
 
423 aa  47.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  27.81 
 
 
910 aa  46.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  38.24 
 
 
892 aa  46.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  38.24 
 
 
898 aa  46.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
263 aa  46.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  36.62 
 
 
1090 aa  46.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  35.44 
 
 
1065 aa  46.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  38.24 
 
 
898 aa  46.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  32.1 
 
 
957 aa  46.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.52 
 
 
572 aa  45.8  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 
986 aa  45.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.85 
 
 
555 aa  45.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  37.66 
 
 
982 aa  45.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  26.91 
 
 
1081 aa  45.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>