70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4914 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.49 
 
 		 1697 aa  732    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  33.85 
 
 		 1702 aa  744    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  33.97 
 
 		 1417 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  34.28 
 
 		 1748 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 1697 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1693 aa  766    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.12 
 
 		 1932 aa  733    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  33.9 
 
 		 1606 aa  737    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.38 
 
 		 2077 aa  969    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  41.77 
 
 		 1642 aa  1241    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  36.93 
 
 		 1649 aa  972    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.54 
 
 		 2570 aa  760    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  34.75 
 
 		 1925 aa  796    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.63 
 
 		 1701 aa  734    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 1575 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.92 
 
 		 1700 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.37 
 
 		 1722 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  42.16 
 
 		 1669 aa  1242    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  41.1 
 
 		 1669 aa  1253    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  39.2 
 
 		 1726 aa  1127    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  100 
 
 		 1706 aa  3518    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  33.85 
 
 		 1703 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.74 
 
 		 1934 aa  717    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.63 
 
 		 1516 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  36.48 
 
 		 2098 aa  875    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  28.38 
 
 		 2117 aa  602  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 1674 aa  599  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  32.37 
 
 		 2274 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  29.69 
 
 		 1956 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 1594 aa  546  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  33.46 
 
 		 1211 aa  523  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.49 
 
 		 2005 aa  473  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 976 aa  423  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  33.56 
 
 		 763 aa  291  7e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  35.27 
 
 		 761 aa  280  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  30.11 
 
 		 766 aa  208  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 526 aa  173  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  29.43 
 
 		 470 aa  155  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  28.84 
 
 		 577 aa  115  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  29.29 
 
 		 1328 aa  105  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  31.34 
 
 		 284 aa  89  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.36 
 
 		 1379 aa  82  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  22.15 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  24.65 
 
 		 339 aa  67  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  31.39 
 
 		 468 aa  61.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  57.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  30.85 
 
 		 442 aa  57.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 669 aa  56.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  23.69 
 
 		 341 aa  54.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.9 
 
 		 919 aa  52  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  24 
 
 		 277 aa  51.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  24.09 
 
 		 1065 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  24.09 
 
 		 1065 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 986 aa  49.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 968 aa  48.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 1031 aa  48.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  32.58 
 
 		 958 aa  48.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  31.91 
 
 		 595 aa  48.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 		 958 aa  47.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.27 
 
 		 254 aa  47.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  26.16 
 
 		 953 aa  47  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  32.14 
 
 		 957 aa  47  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  25.93 
 
 		 1081 aa  46.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 		 969 aa  46.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0106  helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 443 aa  46.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1167 aa  46.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  21.54 
 
 		 971 aa  45.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 1058 aa  45.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  37.04 
 
 		 933 aa  45.8  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  30.17 
 
 		 872 aa  45.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>