34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2349 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  96.62 
 
 
341 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  34.1 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  27.46 
 
 
1606 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
1575 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  31.67 
 
 
1702 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.93 
 
 
1697 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  30.34 
 
 
1693 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  29.41 
 
 
1417 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  30 
 
 
1701 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  29.06 
 
 
1700 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  30.89 
 
 
1703 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
1697 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.33 
 
 
1726 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  27.93 
 
 
2005 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 
2570 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
1516 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  29.92 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  27.35 
 
 
1748 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  27.27 
 
 
1669 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  25.43 
 
 
2077 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  26.27 
 
 
1669 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  31.77 
 
 
1925 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1642 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  29.86 
 
 
2098 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
1674 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  25.21 
 
 
2274 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  25.27 
 
 
1956 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  25 
 
 
1706 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  26.92 
 
 
1932 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  22.67 
 
 
1649 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  26.52 
 
 
1934 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
577 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  24.89 
 
 
1722 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>