40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8083 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  79.22 
 
 		 1697 aa  1871    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  74.16 
 
 		 1697 aa  1714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  81.84 
 
 		 1417 aa  1514    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  54.75 
 
 		 1693 aa  1226    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  77.68 
 
 		 1702 aa  1823    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  76.92 
 
 		 1748 aa  1786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  100 
 
 		 1211 aa  2471    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  81.22 
 
 		 1701 aa  1900    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  76.92 
 
 		 1700 aa  1774    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  69.51 
 
 		 1703 aa  1667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  76.66 
 
 		 1516 aa  1780    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  35.17 
 
 		 1642 aa  592  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  36.1 
 
 		 1669 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.16 
 
 		 2077 aa  592  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  35.11 
 
 		 1669 aa  589  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.49 
 
 		 1726 aa  526  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  33.42 
 
 		 1606 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  32.53 
 
 		 1575 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.89 
 
 		 1706 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  31.75 
 
 		 2098 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  32.04 
 
 		 1649 aa  498  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  31.98 
 
 		 1925 aa  482  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  29.4 
 
 		 1932 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  28.75 
 
 		 1934 aa  421  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 1594 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.84 
 
 		 1722 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  27.18 
 
 		 2274 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  29.22 
 
 		 1956 aa  344  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.76 
 
 		 2117 aa  343  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  26.62 
 
 		 2570 aa  342  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 976 aa  333  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  29.3 
 
 		 2005 aa  327  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 1674 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  24.65 
 
 		 761 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  26.34 
 
 		 763 aa  130  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.09 
 
 		 1328 aa  89.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  22.87 
 
 		 766 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 577 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.3 
 
 		 1379 aa  60.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 		 559 aa  46.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>