97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1824 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.41 
 
 		 1703 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34.76 
 
 		 1649 aa  822    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 2570 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  38.28 
 
 		 1642 aa  990    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.05 
 
 		 1697 aa  768    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  32.89 
 
 		 1701 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  35.72 
 
 		 1932 aa  803    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 1575 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  36.22 
 
 		 1934 aa  825    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  48.03 
 
 		 2077 aa  1259    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  30.87 
 
 		 1606 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 1516 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  100 
 
 		 2098 aa  4275    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.85 
 
 		 1700 aa  773    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  36.3 
 
 		 1706 aa  874    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  39.08 
 
 		 1669 aa  988    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  33.95 
 
 		 1697 aa  779    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  33.64 
 
 		 1417 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  38.22 
 
 		 2274 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.25 
 
 		 1722 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  32.73 
 
 		 2117 aa  692    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  36.8 
 
 		 1726 aa  948    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  38.77 
 
 		 1669 aa  989    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  33.55 
 
 		 1702 aa  776    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  32.84 
 
 		 1693 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1748 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 1674 aa  614  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.15 
 
 		 1956 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  35.11 
 
 		 1925 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 1594 aa  556  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  40.6 
 
 		 2005 aa  526  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  31.75 
 
 		 1211 aa  499  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 976 aa  420  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  35.68 
 
 		 761 aa  278  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  36.9 
 
 		 763 aa  268  8e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  37.86 
 
 		 766 aa  202  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  35.57 
 
 		 470 aa  187  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  39.78 
 
 		 526 aa  145  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 577 aa  130  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  24.36 
 
 		 1328 aa  103  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  34.48 
 
 		 284 aa  92.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.5 
 
 		 678 aa  87.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.26 
 
 		 1379 aa  87.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  29.47 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  29.86 
 
 		 341 aa  64.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  25.34 
 
 		 341 aa  63.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  23.12 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  22.9 
 
 		 339 aa  57.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.48 
 
 		 1147 aa  56.2  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  23.89 
 
 		 872 aa  55.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  22.82 
 
 		 528 aa  53.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  39.13 
 
 		 889 aa  51.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  32.41 
 
 		 669 aa  50.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 1002 aa  50.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.23 
 
 		 502 aa  49.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  34.67 
 
 		 894 aa  49.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 518 aa  49.7  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  24.39 
 
 		 518 aa  49.7  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 		 810 aa  48.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  33.73 
 
 		 1046 aa  48.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  34.09 
 
 		 1138 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  23.81 
 
 		 1431 aa  48.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  34.67 
 
 		 900 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  40.3 
 
 		 560 aa  48.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  40.35 
 
 		 969 aa  48.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  30.85 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  23.9 
 
 		 518 aa  48.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  23.9 
 
 		 518 aa  48.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 986 aa  47.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  37.5 
 
 		 1082 aa  47  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  27.38 
 
 		 468 aa  47.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.9 
 
 		 1168 aa  47.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  33.33 
 
 		 950 aa  47  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  31.18 
 
 		 952 aa  47  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 405 aa  47  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  27.27 
 
 		 1161 aa  47  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  22.94 
 
 		 481 aa  47  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  29.79 
 
 		 958 aa  46.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  22.64 
 
 		 1141 aa  46.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  38.81 
 
 		 560 aa  46.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 958 aa  46.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  30.53 
 
 		 928 aa  46.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  23.18 
 
 		 1285 aa  46.2  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 1169 aa  46.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  34.69 
 
 		 1169 aa  46.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  40.68 
 
 		 1058 aa  45.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  21.41 
 
 		 1125 aa  45.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  30.25 
 
 		 910 aa  45.8  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>